从CCLE中查找细胞系中基因表达量概要1.pptVIP

从CCLE中查找AML细胞系的基因表达量 从CCLE中查找基因表达量 （1.到broadinstitute的一个子页去下载安装GENE-E. /cancer/software/GENE-E/download.html 由于该软件是java编写的，需要java的一个预安装环境。 从CCLE中查找基因表达量 （2.进入CCLE,选择browse-cell line，之后选择Hist subtype1。选择所要查找的细胞系。（AML） 从CCLE中查找基因表达量 （3.选择download selected annotations 这个下载好的cell line annotation.csv文件将在后面使用到。 从CCLE中查找基因表达量 （4.在搜索栏填写所要查找的基因名 如meis1 从CCLE中查找基因表达量 （5.点击meis1，进入detail page。 从CCLE中查找基因表达量 （5.点击download，下载基因表达量的文件，文件后缀名是.gct. 从CCLE中查找基因表达量 （6.用GENE-E打开下载好的基因表达量的文件，里面有所有细胞系的meis1表达量的比对值。（表达量的值来自于芯片） 从CCLE中查找基因表达量 （7.点击file-annotate columns，选择第一次下载的cell line annotation.csv,