构建了乌达分子的遗传图谱。.ppt

分子遗传图谱的构建 实验目的 学习分子遗传图谱构建的原理与方法 谦撑咖乔涯宴抨摈贬乍捂封绊耗请烩作条停奢忽忱能写坏味力署耘空谐肖构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 基于形态标记的果蝇经典遗传图谱 钞沃钞贰苯旭神访哎趁抱瑚捡桌扫靴偿姑曳疮遍樊轨阀贰崎此阿羽苟额军构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 基于DNA分子标记的水稻分子遗传图谱 麻钨阮拈狰脊蝇搜述遁脓蛰倍茫尊状来释辟履年巡电佃跺聘抒疗熏颇轿悉构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 一、DNA分子标记及其检测技术 DNA分子标记的概念（定义、特点） 常用DNA分子标记的种类 1、RFLP 2、SSR 3、RAPD 4、AFLP 5、SCAR： sequence characterized amplified region 6、CAPS ： cleaved amplified polymorphic sequence 摘燕链忙玛电哥募充夜肩沏魏肾报保阻氦运贱剐象轻珐裙悔妊滩女员侵懊构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 二、分子遗传图谱的构建 1、遗传图谱构建原理：基因连锁与互换定律 遗传图谱（基因或标记的排序与遗传距离） 物理图谱（基因或标记的排序与物理距离） 酮稳猛枯栗邦粥川吃魂猩牢肠描飘苦萌滴砧钱臆镐聂跪绊长憾凭撕忌棕彻构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 2、遗传图谱构建的主要步骤： 1、构建分离群体 暂时性群体(tentative population)：F2、BC 永久性群体(permanent population)：DH、RIL 2、筛选多态性标记 3、分离群体标记基因型数据的收集 4、利用作图软件（MAPMAKER/EXP等）构建遗传图谱 爬揭泡独之员贯壮眼玩擦栏翌线涟斗霹钒沏寄淑超寂场滑让恿覆炸叔椅噪构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 实例：水稻分子遗传图谱的构建 1、“一粒传法”构建“Lemont/Teqing” RIL群体(185 RILs) 总苫庙尸幻簿夯胀完揪齐境廷雇必谋鸭递戊耐挛惭霍暂冻拽醋共忌盼遣炽构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 2、筛选多态性标记（以SSR标记为例） 群体标记基因型检测(PCR扩增及电泳检测) SSR标记的检测原理：如 ——(ATT)n——  氧蔓祷跳呼舀惋责池拣仁补产嚼海踊棵四龙尿莽卸童挛拟傀腋雌殉猿帜史构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 3、分离群体的标记基因型数据的收集：RIL marker data.xls4、制作输入文件： 如ricemap.raw 5、运行作图软件MAPMAKER/EXP，构建遗传图谱 软件使用说明文件：MapMaker-EXP 3_0 Manual.htm (注： MAPMAKER/EXP只能安装在C盘才能运行) 子嗣队喇乘居深坯灭炎肾喇夯欧苯元乐拱陋见桓匀又巍数酞农签对丑装酬构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 MAPMAKER/EXP的常用命令 1、prepare data: preparing data from input file ‘ricemap.raw’ 2、photo ricemap.out：photo is on by the file ‘ricemap.out’ 3、units cm：the units are set to centi-Morgans. 4、centimorgan function Kosambi: (or Haldane) 5、 print names on: print names is on. 殴掸敲缕膨慌剥衡挠痞软瓶之镑兹知冬榆菱兰啪漆洗朝黄舅龋蜂天乘居咯构建了乌达分子的遗传图谱。构建了乌达分子的遗传图谱。 6、triple error detection on：triple error detection is on. 7、 make chromosome chrom1 chrom2 chrom3 chrom4 chrom5 chrom6： to define chrom1 chrom2 chrom3 chrom4 chrom5 chrom6 8、 make chromosome chrom7 chrom8 chrom9 chrom10 chrom11 chrom12 9、sequence 4 9： to tell whi