生物信息学方法在科研设计中的.pptVIP

感谢各位精英光临！ 分析预测蛋白的相互作用（STRING） 如果没有备选基因，探索备选基因 利用别人的研究结果探讨备选基因 利用网上资源：基因表达谱数据 基因富集分析软件GSEA分析已有的基因表达数据 cell cycle genes (E2F1, -2, CDC2, -6) and DNA replication-related genes (MCM4, -5, -6, -7), most of which are associated with early lung development and poor prognosis. In addition, metabolic genes such as ALDH1A3 (a candidate marker for lung cancer cells with CSC-like properties) were identified. 六、拟采取的研究方案及技术路线 这是科研设计中一个重要的核心部分，全部内容都旨在说明“如何具体地进行研究”，因此这一项实际上就是通常所说的实验设计。 实验设计是指导整个实验过程的重要依据，是达到研究目的的一项重要保证。实验设计要为验证假说选择一种最佳方案；在正确的实验设计指导下，可使实验误差减少到最低限度，取得更多的数据资料，保证实验结果的可靠性。 实验设计方案的类型有多种，采用哪一种最合适，主要取决于研究的内容与目的。不论采用哪一种方案，均应重点说明受试对象的种类、选用标准、抽样方法、样本含量、对照分组，处理因素的性质、质量、强度、施加方法，效应观察的项目或指标、检测方法、判断标准，以及数据资料的收集方法和统计学处理方法等。为实验所制定的操作规程和记录表格，亦应在本项内容中加以说明，具体的条文和格式可附于科研设计书之后。 研究方法或其实验设计，就是针对题意并遵循科研三原则（重复、 对照，随机化），对科研三要素（对象、因素、效应）进行合理安排的一个过程。 实验技术方法的选择 生物大分子制备和分析常用技术、蛋白质与核酸的提取与分离、PCR技术、分子杂交与印迹技术、分子克隆技术、外源基因转移技术、基因敲除技术、蛋白质表达技术、分子标记技术、分子改造技术、测序及人工合成技术、基因组学技术、蛋白质组学技术、生物芯片技术、生物信息学技术、RNA研究技术等；细胞学分析技术。 生物学研究常用仪器 电泳仪 流式细胞仪 PCR仪 核磁共振仪 电子显微镜 荧光及共焦显微镜 原子力显微镜 飞行质谱仪 核酸合成仪、核酸测序仪 细胞转染仪 基因调控研究—调控因子结合位点分析 miRNA数据库 SNP研究 七、可行性分析 现有研究条件 研究条件主要指人员条件和物质条件两个方面 人员条件包括研究组成员的数量与质量，特别是科研工作经验、现有技术水平和能投入该项研究的时间，本项只要求重点介绍课题负责人的主要情况。 物质条件包括仪器、设备、材料、经济力量以及研究对象（包括实验动物、患者）等；其中最主要的是本项研究所需之仪器和设备是否齐全或基本具备，其性能如何，精确度有多高、可供使用的程度有多大等亦需作一说明。一些较大的研究课题，还要说明有无专门的实验室或其他实验措施。 为了了解EGFR需要检索基因，登陆NCBI检索 蛋白质一级结构分析 蛋白质二级结构分析 蛋白跨膜结构分析 蛋白质三级结构分析 蛋白质GO分析 分析蛋白相互作用通路 （KEGG） 二、前言 有的科研设计书专门设有这一项，许多科研设计书内虽无此项要求，设计者也常主动加上一段，称为前言、引言、序言或绪言。这一小段文字主要是引导文章开端，起“破题”作用，在一段文章中往往是不可少的，但在科研设计书中(特别是填写式的)若无此项目则完全可以不要，可直接入手一开头就写“立题依据”。 三、立题依据 要求回答“为什么要研究这个课题”，应该着重说明选定这一课题的出发点以及主观与客观的条件是什么，选题的独创性、完成的可能性及其实际意义（实用性）如何。必要时尚需进一步说明，这个问题是根据什么临床经验、动物实验或其他间接经验提出来的。情报调研的情况和预试验的初步结果亦应在本项中反映出来，以增加确立这一选题的依据性。 情报调研 一、《中文科技资料目录》医学与《外目》医学 二、《医学索引》（INDEX MEDICUS，简称IM） 三、《医学文摘》（EXCERPTA MEDICA，简称EM） 四、《生物学文摘》（Bio