计算识别磷酸化和o-β-糖基化的相互作用的人类蛋白occludin损害丙型肝炎 .docVIP

计算识别磷酸化和O-β-糖基化occludin损害丙型肝炎病毒进入occludin似乎是最有前途的有研究表明， occludin的活动依赖于它的磷酸化状态，和磷酸化occludin的集体在HCV感染放松管制的紧密连接（ TJ）减少肝细胞的完整性，有利于HCV进入详细的翻译后修饰（PTMS） occludin的信息仍然是个谜。除了磷酸化，几种蛋白质的丝氨酸/苏氨酸残基也受一种独特类型的被称为O-β-糖基化，这种串扰作为一个功能开关。要确定潜在的O- β -糖基化和磷酸化和O- β -糖基化之间的相互作用可以被利用为抑制HCV进入，在这里，我们报告的人类紧密连接蛋白的翻译后修饰的计算分析。一些保守的磷酸化残基和激酶，可以改变occludin的规范诚信的紧密连结的能力进行了鉴定除了以往报告的酪氨酸残基，酪氨酸残基（ Tyr29 ， Tyr287 ）被确定为Src激酶的目标网站。据我们所知，这是第一个研究报告的O- β-葡萄糖的潜在occludin的站点和目标站点， ERK（ Ser8 ， Ser310 ， Thr345 ） ，GSK- 3 （ Ser8 ， Ser341 ）和Cdk5 （ Thr376 ） 。此外，根据这项研究的结果，还提出了一个潜在的新的两阴阳网站（ Ser408和Ser490 ）的磷酸化和O- β-糖基化之间的相互作用。是的一个多功能tetraspan跨膜蛋白，上皮细胞紧密连接（TJS） 。在过去的15年中，已经进行了大量的研究occludin的多种功能初步研究表明， occludin参与TJS组装然而，最近的研究表明，紧密连接蛋白基因是必不可少的，在装配以及监管TJS起着重要的作用。TJS是分子空间结构的关键因此，旁运输的主要决定因素旁空间，支架蛋白链接膜蛋白，肌动蛋白细胞骨架脂肪变性肝硬化和肝癌的主要原因之一发展急需的抗病毒治疗和有效的疫苗已被限制病毒进入和蔓延的过程中，提出作为潜在的治疗点也提出抑制病毒进入以防止再感染丙型肝炎病毒感染的患者接受移植的肝移植HCV通过肝细胞的附着和进入是一个复杂的多步骤的过程仍无法完全了解然而丙型肝炎病毒需要两个病毒的包膜糖蛋白E1和E2和多个主机蛋白的高效的附着和进入由HCV被利用的宿主因素包括低密度脂蛋白受体tetraspanin CD81，清道夫受体B类I型和claudin-1有趣的是所有目前已知的由丙型肝炎病毒利用宿主因素是跨膜TJ的蛋白质在肝细胞中位于地面的TJS是介导细胞与细胞间的联系与沟通并建议是“水泥”的积木和肝炎病毒进入的“门” 这些宿主因子的鉴定发现有更深的了解丙型肝炎发病机理和治疗是有前途的但是，观察一些抗丙型肝炎病毒进入人类细胞系和细胞株的非灵长类动物的起源也观察到类似的电阻即使在这些宿主因子的强制表达从而表明存在一个追记因素直到最近发现的人类紧密连接蛋白TJ蛋白被证明是一个重要组成部分丙型肝炎病毒进入这一发现后不久一些研究主要集中在表征的HCV- occludin的关系和识别潜在的机制要求occludin证明无论是沉默的occludin表达HCV-的宽容细胞或过度表达的所有关键条目的因素在人类和小鼠细胞株丙型肝炎病毒进入细胞的抗丙型肝炎病毒感染从最近的另一项研究研究者发现丙型肝炎病毒感染血管内皮生长因子（VEGF）的负调控肝细胞TJ完整性和极性的一种新的血管内皮生长因子受体2依赖性途径来更清楚地了解如何occludin的调节HCV进入（PTM）如磷酸化来调节细胞核和细胞质的蛋白质的功能并且还包括occludin被称为是极大地影响了磷酸化丝氨酸（Ser） ，苏氨酸（Thr ），酪氨酸（Tyr ）残基的胞质尾的功能和调节occludin中断TJS的因素如钙耗损佛波醇酯pathogens，改变其磷酸化模式occludin的磷酸化/去磷酸化事件有直接参与在保持完整的TJS除了磷酸化是另一个动态PTMO-β-糖基化的存在于几乎所有的真核有机体相反调制的磷酸化激酶β- O-糖基化是由一个单一的酶的活性调节O-连接的N-乙酰葡萄糖胺（O-葡萄糖）转移酶（ OGT）是已知的相同或邻近的Ser和Thr残基上的磷酸化和O -GlcNAc的修改发生在几个核和胞浆蛋白这就是所谓的阴阳假说和丝氨酸/苏氨酸残基，两个翻译后修饰在这个复杂的相互作用被认为是杨成贤网站通常情况下阴阳网站作为一个功能开关和中断这个过程可能修改的蛋白质或永久或关闭成为同时在转录和翻译水平PTM网站用实验方法是昂贵和费时的相比之下推进培训实验数据的计算算法可以提供功能性的候选人并帮助缩小试点工作更为可取其有效性在识别潜在的蛋白质的利益的PTM目标网站在目前的研究中我们定义了一个在硅片的工作流程包括机器学习算法和选择参数进行识别和分析在人类紧密连接蛋白的翻译后修饰然后假定目标提出尹押嗯位点的磷酸化和O-