串联质谱蛋白质鉴定的关键计算问题.pdfVIP

第 8 卷第 1 期 信息技术快报 Vol.8 No.1 Information Technology Letter Jan. 2010 串联质谱蛋白质鉴定的关键计算问题 付岩 贺思敏 孙瑞祥 王乐珩 摘要： 蛋白质鉴定是蛋白质组学研究的基础问题，而利用串联质谱搜索蛋白质序列数据库是目前蛋白质鉴 定最成功和最常用的方法。蛋白质鉴定软件本质上是一个信息检索系统，具有检索系统的共性，但与文本 或多媒体检索相比，又有其非常特殊之处，比如对检索结果进行可靠性评估是蛋白质鉴定必不可少的一步， 而这对于其它检索问题往往是不需要的。本文综述蛋白质鉴定搜索引擎中的关键计算问题及其研究进展， 包括数据库搜索匹配打分、鉴定结果可靠性统计评估、蛋白质修饰鉴定等，并对我们自己研制的蛋白质鉴 定搜索引擎 pFind 做简要介绍。