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基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞-中国农业科学
中国农业科学 2017,50(9):1694-1704
Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2017.09.015
基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞
HT29的作用机制
刘鹭,芦晶,王莹,逄晓阳,许嫚,张书文,吕加平
(中国农业科学院农产品加工研究所/农业部农产品加工与质量控制重点开放实验室,北京 100193 )
摘要:【目的】对紫色杆菌素作用后的结肠癌细胞HT29进行差异蛋白质组学分析,探究其影响的代谢通路,
揭示其抑制癌细胞生长的作用机制,为新型抗癌药物的开发提供一定的参考。【方法】以不同剂量的紫色杆菌素处
理 HT29 24、48、72 h,通过 MTT 试验以及透射电镜分析其对结肠癌细胞的有效抑制剂量及抑制情况。在此基础
上,对提取的3 个处理组的蛋白进行同位素标记,利用反相液相色谱(RP-LC)联用串联质谱(AB SCIEX Triple TOF
5600)获得样品中的多肽及其相对丰度信息,通过数据库(NCBI. Human. protein database)搜索比对,鉴定差
异表达蛋白。利用GO分析、KEGG信号通路分析,解析紫色杆菌素抑癌作用代谢途径。【结果】紫色杆菌素对HT29
的抑制作用呈一定的时间、剂量依赖性。当紫色杆菌素对HT29的抑制率达50%时,仅为阳性药物5-Fu剂量的1/6,
具有更明显的抑制效果。电镜下观察显示,随着紫色杆菌素剂量增大,细胞内部线粒体出现空泡结构,质膜出泡;
当浓度达 30 mg·L-1 时,细胞膜消失,染色质边集。通过差异蛋白质组学分析,共鉴定出 4 258 个蛋白,表达差异
在 2 倍以上的蛋白共为 757 个。其中高剂量组处理差异蛋白数为 492 个,低剂量组处理的差异蛋白数为 112 个,
阳性对照组差异蛋白数为336个。KEGG分析显示这些差异蛋白共参与50条信号通路。其中有10条信号通路具有
显著性(P0.05),主要参与核糖体循环途径、三羧酸循环途径和 RNA 降解途径等。【结论】紫色杆菌素主要通过
影响HT29细胞生命活动中的蛋白转录和翻译水平进而发挥抑制作用。
关键词:差异蛋白质组学;紫色杆菌素;HT29;iTRAQ同位素相对标记和绝对定量;透射电镜
Antitumor Effect of Violacein Against HT29 by
Comparative Proteomics
LIU Lu, LU Jing, WANG Ying, PANG XiaoYang, XU Man, ZHANG ShuWen, LÜ JiaPing
(Institute of Agro-products Processing Science and Technology, Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of
Agro-Food Processing and Quality Control, Ministry of Agriculture, Beijing 100193)
Abstract: 【Objective 】The objective of this experiment is to investigate proteomic profile of HT29 treated with
high-dosage-violacein and low-dosage-violacein, and to analyze its involved metabolic pathway and mechanism. 【Method 】
Cytotoxic activity of violacein was analyzed by MTT ass
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