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单链寡核苷酸在Hela及Human Liver细胞系EGFP荧光报告系统中的定点纠错分析
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LNer细胞系
苎竺塞堕嘏在Hela及Human
EGFP荧光报告系统中的定点纠错研究
摘 要
{
/
f基因治疗是指改变活细胞遗传物质的一种医学治疗方法,即采用分子生物学的方法
一~~一一-
和原理,在核酸水平上开展疾病治疗。自1990年9月首例患者接受基因治疗以来,已
有数千名患者接受了基因治疗,但无一例能产生明显疗效。主要问题在于基因治疗的安
全性,效率,伦理道德及靶向性问题,均未得到有效解决。其中靶向性问题关系到外源
基因能否被导入到特定的细胞,并进一步在基因组上的特定位点发挥作用,是基因治疗
成功与否的关键。广义上,靶向性基因治疗还包括另外三个水平:在组织水平上,将目
的基因导入特异性的靶组织或靶器官;在基因水平上,将目的基因整合到基因组上的特
定位点;在表达水平上,调控目的基因在特定的时机表达。而狭义的靶向性基因治疗,
仅指基因水平上的靶向性治疗。基因组水平上的靶向性治疗即目的基因在基因组上的
特异性整合与纠错,包括基因原位置换和原位基因修复。RNA/DNA嵌合寡核苷酸,以
及硫代修饰的单链寡核苷酸最近被用于基因定点纠错。RNA/DNA嵌合寡核苷酸由68
个碱基组成的单链寡核苷酸,其自身可折叠形成双链结构。双链区与基因组中靶序列有
25
nt的同源序列,在组成该同源区的双链中,一条链全由DNA组成,另一条链由2段
各10个碱基的RNA及中间的5个碱基的DNA组成。同源序列与基因组中靶序列相比,
只有一个碱基不配对,该错配碱基位于同源序列中间。同时2.0.甲基化修饰RNA残基
以防止RNase
H对RNA/DNA杂合链的降解;在双链的两端各有一个由4个T碱基组
成的发卡环结构,赋予这种双链拓扑学上灵活性:同时在3’端引入5个配对的GC桥稳
定这种二级结构,同时使得单链寡核苷酸的5’与3’端相邻排列,中间仅存在一个缺口。
RNA,DNA嵌合寡核苷酸最初因其有效性引起人们关注,但随着研究工作的深入,人们
发现用单链寡核苷酸也可得到与嵌合寡核苷酸接近的效率。由于单链寡核苷酸具有成本
、
低,质控好的优势,现多集中于单链寡核苷酸的研究,尤其是硫代寡核苷酸的定点纠错。扩
/
在本研究中,应用我们实验室已有的Hela.F5突变EGFP荧光报告系统,及新建
!里垃塑堕型盔兰擅圭堂堡鲨塞
Livercell
的Human
饰的寡核苷酸的定点纠错作用。突变EGFP荧光报告系统的优势在于,可以通过荧光
显微镜和流式细胞仪在细胞水平观察纠错情况,较DNA水平测定纠错效率,更直观,
更迅速。在肝脏细胞系中建立此报告系统,将有助于本实验室通过寡核苷酸治疗鸟氨
酸氨甲酰转移酶缺陷症(OTC,omithine
transcarbamylase
谢性疾病。由于甲基化尿嘧啶修饰的单链寡核苷酸的最适长度为45nt,因此推测硫代
修饰的寡核苷酸的适宜长度也为45nt。1或2个硫代修饰的寡核苷酸较3或6个硫代
修饰的寡核苷酸毒性小。结果显示,45nt长1或2个硫代修饰的寡核苷酸纠错效率低
于25nt含6个硫代修饰的寡核苷酸,而相当于或略高于25m含3个硫代修饰的寡核
苷酸。纠错效率是判断寡核苷酸优劣的重要因素,但不是唯一因素。6个硫代修饰的
寡核苷酸对细胞毒性大,因此并不适合作治疗工具。在不同长度,含不同硫代修饰的
寡核苷酸中,寻找效率与毒性之间的平衡点至关重要。另外,本实验在肝脏细胞系(HL
cell
lines)中进行硫代寡核苷酸的壅盛塞銮,为治疗鸟氨酸氨甲酰转移酶缺陷症等点
突变遗传代谢性疾病打下了基础。
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