ISW2缺失下基因功能对核小体定位影响的研究.pdf

Biophysics 生物物理学, 2015, 3(4), 67-76 Published Online November 2015 in Hans. /journal/biphy /10.12677/biphy.2015.34007 The Impact of Gene Function on Nucleosome Positioning in the Absence of ISW2 Huan Hu, Jihua Feng, Henhen Wei, Xiaowen Zhou, Zehua Li School of Electrical and Information Technology, Yunnan University of Nationalities, Kunming Yunnan th nd th Received: Jan. 8 , 2016; accepted: Jan. 22 , 2016; published: Jan. 29 , 2016 Copyright © 2015 by authors and Hans Publishers Inc. This work is licensed under the Creative Commons Attribution International License (CC BY). /licenses/by/4.0/ Abstract To study the impact of chromatin remodeling factor on nucleosome positioning and the function of gene in the formation of nucleosomes in the absence of ISW2, this paper compares and analyzes the data on the proportion of nucleosomes in three kinds of yeasts, which are cultured without ISW2, WT or in YPD. The study finds that in the absence of ISW2 the nuclesomes are far from TSS and that 11 genes impose noticeable impact on nuclesome positioning. Keywords Nucleosome Positioning, Gene Ontology, ISW2, WT, YPD ISW2缺失下基因功能对核小体定位影响的研究 胡 焕，丰继华，魏恨恨，周晓雯，李泽华 云南民族大学电气信息工程学院，云南 昆明 收稿日期：2016年1月8 日；录用日期：2016年1月22 日；发布日期：2016年1月29 日 摘 要 为研究染色质重塑因子对核小体定位的影响以及ISW2缺失情况下基因功能对核小体形成的作用，本文分 文章引用: 胡焕, 丰继华, 魏恨恨, 周晓雯, 李泽华. ISW2 缺失下基因功能对核小体定位影响的研究[J]. 生物物理学, 2015, 3(4): 67-76. /10.12677/biphy.2015.34007 胡焕 等 别对ISW2敲除、野生型(WT)及富营养培养条件下(YPD)三种酵母核小体占位率数据进行聚类、比较、 分析后发现，在ISW2缺失情况下核小体的位置远离TSS，同时发现11种基因功能对核小体的定位产生了 显著影响。 关键词 核小体定位，基因功能(GO) ，ISW2，野生型，富营养培养 1. 引言 真核细胞中的DNA 与有关蛋白质之间的连接称作染色质。染色质是所有遗传物质的载体，在生物群 体中，染色质的结构特征具有相对的保守性，对不同种类生物的染色质进行分析研究能够揭示各种物种