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纤维素酶糖苷水解酶及其降解机理
纤维素酶类糖苷水解酶及其降解机理;4.1 导言; 自从 1906年在蜗牛消化液中首次发现纤维素酶后,人类对其研究经历了百年历史:
1950--木酶的发现,C1-Cx假说。
1980 年至 1988 年--利用基因工程的方法对纤维素酶的基因进行克隆和一级结构的测定。
90年代--厌氧细菌纤维小体超分子复合体结构功能研究,多结构与体系的发现。
21世纪--基因及氨基酸序列,分子时代。;4.2 纤维素酶系统的组成;(3)β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,EC.3.2.1.21,简称 BG),这类酶水解纤维二糖和短链的纤维寡糖生成葡萄糖。对纤维二糖和纤维三糖的水解很快,随着葡萄糖聚合度的增加水解速度下降。;4.3 糖苷水解酶家族;;;;4.4厌氧细菌纤维素酶的结构与功能;4.4.1 纤维小体的一般组装模式;4.4.1 纤维小体的一般组装模式;4.4.1 纤维小体的一般组装模式;4.4.2 粘连模块与对接模块;盆购膛动独火祁誉且疵牧疗旭米耪瓷靠茵刻卖背安冒仪外羔屑喜硷琉宰融纤维素酶糖苷水解酶及其降解机理纤维素酶糖苷水解酶及其降解机理;4.4.2.2对接模块;柜炼证痊泊浇焦赞专扬饺泉培耪佰兹婆舟梯零畅荣滞薛噪翌碗豁沽思磨词纤维素酶糖苷水解酶及其降解机理纤维素酶糖苷水解酶及其降解机理;4.4.2.3粘连模块和对接模块相互作用;
粘连模块与酶上对接模块在种内的结合是非专一性的,而在种间的相互作用却是专一性的。生化水平上,包含对接模块的酶与包含粘连模块的脚手架间的结合本质上是非特异性的。
对接过程中粘连模块总体结构本质上不变,对接模块发生了构象变化。
;图4.4 热纤梭菌Ⅰ型粘连模块红色和Ⅰ型对接模块蓝色相互作用示意图;4.4.3 纤维小体上的催化模块;4.4.3.1典型的纤维小体外切酶(或持续性内切酶)的空间结构;厌氧细菌纤维素酶的结构与功能;根据序列和结构的相似度,CBM可被分成不同的家族。不同纤维小体家族中按功能分主要属于A型和B型。
4.4.4.1 脚手架上的CBM
;
酶上的CBM不是保持酶复合体接近底物表面所必需的结构。然而其具有潜在的功能,似乎是单个酶专一性结合底物,特别是其在分子水平上结合单个底物分子链(如可溶性的β- 葡聚糖或木聚糖链)。
酶分子模块上的CBM既有A型也有B型。;4.4.4.3纤维小体和游离酶上的CBM比较;4.4.4.4 影响小体与底物结合的因素;4.4.5纤维小体的多样性;图4.5;厌氧细菌纤维素酶的结构与功能;厌氧细菌纤维素酶的结构与功能;4.4.6 纤维小体基因在基因中的分布规律;4.4.7 微型人造小体的研究进展;与天然纤维小体相比,有三个主要的不同之处:
1)含有酶的数量有限。
2)是同源性的。
3)每个酶在微型手脚架蛋白上的位置是受到控制的。
未来前景包括构建新的杂交手脚架蛋白,使之能够将三个或多个不同的酶结合到特定位点上。嵌合体的稳定性也是影响它将来工业化应用的一个因素。
;4.5好氧真菌纤维素酶的结构与功能;4.5.1 催化结构域及催化断键机理;好氧真菌纤维素酶的结构与功能;图4.9;有待研究的问题:
1.结晶纤维素表面如何游离出单根葡聚糖分子链。
2.单根葡聚糖链如何快速准确地进入CBH的催化孔道中。
3.葡聚糖链如何在催化孔道中高效地持续性单方向运动。;4.5.2 纤维素结合结构与的结构与功能;好氧真菌纤维素酶的结构与功能;CBM的功能
推测其功能是将催化结构域拉近到不溶性的纤维表面,使纤维素水解过程易于进行。但是其功能及催化中的分子机理仍未形成共识。;4.5.3 链接区的结构与功能;4.5.3 链接区的结构与功能;4.6 纤维素酶持续性降解结晶纤维素 的动态催化过程;4.6.1 纤维素酶分子-底物之间的结合过程;4.6.2 外切纤维素酶对底物分子的催化断键过程;4.6.2.2 共价糖基-酶中间体的形成
催化循环的第一步;4.6.2.3 异头碳的恢复;4.6.2.3 异头碳的恢复;4.6.3 外切纤维素酶催化降解结晶纤维素的分子内协同模型;4.6.4 外切纤维素酶持续性催化过程动力从何而来;小结;谢谢!
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