江西典型红壤区土壤细菌基因组文库构建及功能初步分析3 - 土壤学报.pdf

第 43 卷 第 6 期 土 　壤 　学 　报 Vol43 ,No6 2006 年 11 月 ACTA PEDOLOGICA SINICA 　Nov. ,2006 江西典型红壤区土壤细菌基因组文库构建 及功能初步分析 黄婷婷 　崔中利 　张 　璐 　曹 　慧 　李顺鹏 (南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室 ,南京 　210095) CONSTRUCTION OF TYPICAL RED SOILDERIVED META GENOMIC L IBRARY AND FUNCTIONAL ANALYSIS IN JIANGXI PROVINCE Huang Tingting 　Cui Zhongli 　Zhang Lu 　Cao Hui 　Li Shunpeng ( Key L aboratory of Microbiological Engineering of Agricultural Environment , Ministry of Agriculture , N anj ing Agricultural University , ) N anj ing 　210095 , China 关键词 　　红壤 ;DNA 提取 ;基因组文库 ;序列分析 中图分类号 　　S1543 ; Q9381 　　　　　文献标识码 　　A 　　地球上的微生物 , 仅原核生物细胞总数就大 合生物学软件初步分析 ,预测其中包含的基因序列 30 30 6 约在 4 ×10 ～6 ×10 ,包含的独立基因型在 10 ～ 及相应蛋白功能 。 8 [ 1] 10 种之间 。因此 ,微生物所具备的分类 、功能 、 遗传和系统发育等多样性在维持生物圈生态平衡 1 　材料与方法 和为人类提供资源方面起着重要的作用[2 ] 。然而 长期以来 由于受到研究方法和手段 的限制 , 土壤 11 　研究区域和土壤 中绝大多数微生物的功能还不清楚 。环境样品的 研究区域位于江西省鹰潭市余江县刘家站 ,该 ( ) 宏基因组学 metagenomics 是对环境样品中微生物 地区为 中亚热带温 暖湿润 的季风气候 , 年均温 群体基因组进行的分析 , 该方法在众多用于获得 178 ℃,年均降雨量 1 785 mm ,主要集中在 4～6 月 。 未培养微生物 的生理和遗传特性的方法 中 , 逐渐 地形为低丘岗地 ,海拔 350 ～546 m ,坡度为 5°～ [3 ,4 ] [ 12 ] 显示出强大的优势 。国外 已有从不 同环境样