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人白细胞介素-36α蛋白的二级结构及其b细胞抗原表位的预测 - 海南医学
Hainan Med J, Apr. 2014, Vol. 25, No. 8 海南医学2014年4月第25卷第8期
doi:10.3969/j.issn.1003-6350.2014.08.0428 ·论 著·
人白细胞介素-36α蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位的预测
陈少英,郑 坚,牛青霞
(汕头大学医学院炎症与免疫性疾病研究所,广东 汕头 515041)
【摘要】 目的 预测并分析人白细胞介素-36α蛋白的二级结构及其潜在的B 细胞抗原表位。方法 以人
IL-36α蛋白的氨基酸序列为基础,采用生物信息软件和互联网服务器预测人IL-36α蛋白的二级结构及其亲水
性、可及性和柔韧性,根据预测结果综合分析IL-36α蛋白可能的B 细胞抗原表位。结果 IL-36α蛋白潜在的B
细胞抗原表位位于N 端8~12、33~38、111~116和143~149氨基酸区段。结论 预测了IL-36α蛋白的二级结构和
B 细胞抗原表位,为进一步研究IL-36α的生物学活性部位及利用合成肽制备抗IL-36α的多克隆抗体提供了理论
依据。
【关键词】 白细胞介素-36α;生物信息学;二级结构;表位
【中图分类号】 R392.11 【文献标识码】A 【文章编号】 1003—6350(2014 )08—1097—03
Prediction of the secondary structure and B-cell epitopes of human interleukin-36α. CHEN Shao-ying,
ZHENG Jian, NIU Qing-xia. Institute of Inflammation and Immune Diseases, Shantou University Medical
College,Shantou515041,Guangdong,CHINA
【Abstract】 Objective To predict the secondary structure and B-cell epitopes of human interleukin ( IL)-36α.
Methods Based on the IL-36αamino acid sequence, the secondary structure, hydrophilicity, flexibility and accessi-
bility indexes of human IL-36αwere analyzed with bioinformatics tool and network servers. Combined the results ac-
cording to these methods, the B-cell epitopes of IL-36αwere predicted. Results The predicted B-cell epitopes of hu-
man interleukin-36αwere probably located in or adj acent to 8~ 12, 33~38, 111~ 116 and 143~ 149 aa in the N-terminal.
Conclusion The secondary structure and B-cell epitopes predicted provide the basis for estimating the activity sites
and developing antibodies against human IL-36α.
【Keywords】 Interleukin-36α; Bioinformatics; Secondary structure; Epitope
白细胞介素-1家族(Interleukin-1 family,IL-1F)的
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