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虎mtDNA cyt b和D-loop区序列特点及其在亚种识别中意义的研究
摘 要
本文克隆并测定了13只东北虎mtDNA
b基因和D.100p区序列的特点及其在亚种识别中的价值。研究发
进行了分析,研究了cyt
D.Loop区中存在着两种序列:一是与其他物种同源性很高的“正常序列”,称为“短序
列”:二是带有22幻的插入片断的“菲正常序列”,称为“长序列”。11个“短序列”
序列”闽的同源性为75.5—81.6%。上述发现表明,在选择亚种识别遗传标记时,应区别对
待D—loop区的两种序列;本文所研究的区域因为两种序列间的差异很大,所以不适合用
作系统进化的分析。在32个虎mtDNA
cytb
1140bp的序列中,共发现14个位点存在变异,
入。在cytb基因上共检出lO种单倍型,各亚种均有特有的标志性碱基,亚种闯无共享单
b基因上识别东北
倍型。这表明mtDNAb基因非常适合虎亚种识别;本文提出了cyt
cyt
虎、孟加拉虎、印支虎、苏门答膳虎4个翌种的特异性单倍型。
b基因,亚种识别
关键词:虎,mtDNA,D—loop,cyt
Abstract
Anlur and
A of in of13 mtDNAwerecloned
sequence region
381bpD—loop tiger
32 b of4
ofAmur and ofcyt
tiger tiger
sequenced.2sequences D—loopregion sequencesgone
to
inGenBankwerealsocombinedourdatainthe ofcharacteristicsofthe
subspecies analysis
that
two for of identification.Theresultshowed
theirsignificauce
regionsevaluating subspecies
79 sites werefoundwithinthe in
381bp D—loop;Two
polymorphicfo舭ing甚baplotypes region
in Amur thatis
of wgrediscovered of
types tiger,Short
sequence
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