2013.12.2 ---- 成东林NGS的革命及其对基因组学研究的影响.pptxVIP

NGS的革命及其对基因组学研究的影响;主要内容;基因组研究 ---- 技术和分析;NGS ---- 基因组变异的检测;NGS ---- 基因组变异的检测;NGS ---- 遗传性疾病;NGS ---- 遗传性疾病;NGS ---- 癌症基因组;COSMIC: Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer 癌症体细胞突变目录 http://cancer.sanger.ac.uk/cancergenome/projects/cosmic/;宏观水平证明癌细胞异质性;可将癌症视为癌细胞的异质性集合，癌细胞不断进化，以达尔文的方式争取生存权和发展权，代价是宿主的健康乃至生命。 由于肿瘤的高度异质性，基于原发灶的检测结果进行针对性治疗不一定能有效地治疗转移灶。;NGS ---- 针对突变靶向性治疗;07年science ，EGFR激酶抑制剂可有效治疗伴有EGFR活性突变的肺癌，但MET通过扩增激活ERBB3信号途径导致肺癌细胞对gefitinib耐药 针对靶向突变进行治疗的文章相继报道(Sequist et al., 2011; Prahallad et al., 2012;Girotti et al., 2013) ;2013年， Dawson用WGS检测30名转移性乳腺癌患者 -- 循环肿瘤DNA、循环肿瘤细胞 其中29名(97%) 检出循环肿瘤DNA，26名(87%)检出CTC，并且CTC DNA为53%的患者提供了最早的治疗反应监测指标;最近（Sci Transl Med）用WGS检测宫颈分泌物中的肿瘤细胞，帮助癌症诊断 高灵敏度的检测这种波动是一种潜在的强有力的疾病监测体系，像CT和MRI一样;Nature Methods 10, 1108–1115 (2013) Network-based stratification of tumor mutations;NGS ---- 个性化医疗第一步癌症分型;1997年，Lo发现，有10%的胎儿DNA漂浮在孕妇的血液中 2010年，Lo推测使用足够多的胎儿DNA片段能重建胎儿完整基因组 2012年(Sci Transl Med )首例非侵入性胎儿测序获得成功：同时对一位孕妇血浆中DNA、父亲唾液及孕妇血液进行测序，通过比较确定胎儿完整基因组 随后与婴儿基因组进行比较，证实预测的准确率超过98%;NGS ---- 无创产前诊断;Thank you for your attention !