海洋二所高性能集群系统使用培训.PDFVIP

海洋二所高性能集群系统 使用培训 曙光信息产业（北京）有限公司 2008.11 培训计划 初步培训——海洋二所集群系统介绍（使得海 洋二所使用人员、管理人员了解系统的组成、 基本的使用）；—12月9 日下午 并行应用基础培训——海洋二所集群并行应用 基础培训（使得海洋二所用户了解、掌握mpi、 OpenMP、PGI等编译器和并行软件的使 用）—12月10 日下午 系统培训——海洋二所集群系统培训（项目验 收后，总结用户的使用情况，进行系统的培训， 使得用户全面掌握集群的管理和使用）—待定 主要内容 海洋二所TC4000A系统架构 TC4000A系统硬件 TC4000A系统软件 系统使用与管理 4000A硬件系统组成 节点机子系统： 64个2U4P计算节点 2个3U4P登录节点 2个3U4P存储节点 （并行文件系统） 网络子系统： 1台Flextronics 20Gb Infiniband高速交换机 2台1000Mb Ethernet交换机 存储子系统： 后端DS8314FF全光存储 （30块300GB） KVM系统 曙光SKVM （1USTS＋68CIM） 机柜/ 电源子系统 5机柜 机柜电源模块＋后端UPS 4000A软件系统组成 曙光4000A机群管理软件：DCAS 曙光4000A机群命令软件：nprsh 曙光4000A机群系统安装：DCIS 曙光4000A机群系统监控：DCMM 存储节点并行文件系统：DCFS 开发环境：PGI8.0 、OpenMPI1.2.8 应用程序：CCSM3、MITgcm 系统性能指标 81920亿次/秒 Linpack效率82 ％＋ 256个64位2.0GHz CPU （1024 Core） 1136GB 内存 9TB FC RAID存储 20Gbps计算网络 1Gbps管理网络 机群架构 机群硬件布局（正面） 主要内容 海洋二所TC4000A系统架构 TC4000A系统硬件 TC4000A系统软件 系统使用与管理 4000A硬件系统组成 节点机子系统： 64个2U4P计算节点 2个3U4P登录节点 2个3U4P存储节点 （并行文件系统） 网络子系统： 1台Flextronics 20Gb Infiniband高速交换机 2台1000Mb Ethernet交换机 存储子系统： 后端DS8314FF全光存储 （30块300GB） KVM系统 曙光SKVM （1USTS＋68CIM） 机柜/ 电源子系统 5机柜 机柜电源模块＋后端UPS 节点机子系统 节点 计算结点 用于进行CCSM3和MITgcm主模式计算 登录结点 用于进行用户登录、系统作业管理、系统维护等功能 存储结点 用于连接后端存储，提供给机群网络文件服务功能 计算节点 采用曙光天阔A820r-FX机架式服务器，配置4路AMD® OpteronTM2.0GHz四核处理器，16GB 内存和32GB 内存， 1块146GB SAS 15Krpm硬盘(可扩展为2块)，2个千兆以 太网卡 每个节点含一个20Gbps Infiniband HCA卡 用于CCMS3和MITgcm主模式计算 登录和存储节点 登录节点：采用曙光天阔A830r-FX机架式服务器，配置4 路AMD® OpteronT