一个预测的木薯衰老相关基因的获得及其功能分析 - 广东农业科学.pdf

广东农业科学… … … … … … … …2017，44（2）：6-11 Guangdong…Agricultural…Sciences…………………………………………………………………………………………………………………………………………………… doi：10.16768/j.issn.1004-874X.2017.02.002 时涛，李超萍，蔡吉苗，等.一个预测的木薯衰老相关基因的获得及其功能分析［J］.广东农业科学，2017，44（2）：6-11. 一个预测的木薯衰老相关基因的 获得及其功能分析 时  涛，李超萍，蔡吉苗，李博勋，黄贵修 （中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室/ …海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室，海南…海口………571101） 摘  要：根据水稻LRR类抗病基因 21的保守结构域设计1对简并引物，提取木薯抗/感细菌性萎 Xa 蔫病种质E1340和GR911的基因组DNA为模板，通过PCR扩增均获得大小约0.5…kb的扩增片段。两个片 段克隆、测序后获得完全一致的474…nt序列，比对发现木薯种质AM560带有与该序列高度同源的核苷酸片 段。提取包括同源片段上下游各约2.2…kb的大片段序列进行基因预测，发现该片段位于1个预测基因内，命 名为SLR 1。该预测基因ORF全长1…641…nt，编码546…aa，与已报道的衰老相关蛋白具有较高的同源性，可能 在木薯衰老相关反应中发挥重要作用。 关键词：木薯；衰老相关基因；功能分析 中图分类号：Q781……………………………………………………文献标识码：A………………………………………………………文章编号：1004-874X（2017）02-0006-06 Obtaining and function analysis of predicted  senescence-associated gene from cassava SHI…Tao，LI…Chao-ping，CAI…Ji-miao，LI…Bo-xun，HUANG…Gui-xiu （Environment and Plant Protection Institute ，Chinese Academy of Trop ical Agricultural Sciences/ Key Laboratory of Integrated Pest Management on Trop ical Crop s ，Ministry of Agriculture/Hainan Key Laboratory f or Monitoring and Control of Trop ical Agricultural Pests ，Haikou 57 110 1，China ） Abstact ：One…pair…of…degenerated…primers…was…designed…based…on…the…conserved…domain…of…resistance…gene… Xa21，which…had…LRR-liked…domain…and…came…from…rice.…The…genome…DNA…of…cassava…germplasm…E1340…and…GR911… was…extracted…and…used…as…template，which…was…resistant…and…susceptible…to…cassava…bacterial…blight…separately.…Two… products…of…about…0.5…kb…were…obtained…by…PCR…reaction.…These…two…products…we