棘孢木霉t4小分子疏水蛋白基因hyb2克隆及序列分析 - 中国农学通报.pdf

中国农学通报 2012,28(34):85-91 Chinese Agricultural Science Bulletin 棘孢木霉T4小分子疏水蛋白基因hyb2克隆及序列分析 古丽吉米拉·米吉提，范海娟，刘志华，王 娜，窦 恺，黄 颖，王志英 （东北林业大学林学院森保学科，哈尔滨150040） 摘 要：为了深入研究生物防治菌棘孢木霉T4 菌株小分子疏水蛋白hyb2 的功能，基于已知小分子疏水 蛋白基因hyb2 部分cDNA 序列设计引物，分别以棘孢木霉T4 菌株菌丝体总mRNA 和基因组DNA 为模 板，进行PCR 扩增，克隆获得hyb2 的全长cDNA 和DNA 序列，其GenBank 接受号分别为JX014433 和 JX 185070，cDNA 序列编码区长度为321 bp ，编码106 个氨基酸。BlastP 相似性分析表明该基因与深绿 木霉的Tahyd5a (ABS59366)基因同源性最高为87% ，SignalP 信号肽分析表明N 端第16和17 个氨基酸 中间有一个信号肽剪切位点(AFA||AP)。Pfam 蛋白家族分析表明它属于hydrophobin_2 superfamily 家 族。将棘孢木霉T4 菌株小分子疏水蛋白基因hyb2 对深绿木霉ATCC74058 基因组和绿色木霉Gv29-8 基因组进行同源性搜索，在2 个近缘种的基因组上分别获得9 个和8 个同源序列。其中，深绿木霉 ATCC74058 的hyb-a-7 和绿色木霉Gv29-8 的hyb-v-5 疏水蛋白与棘孢木霉hyb2 相似性最高分别为87% 和70% ，2 个序列分别位于深绿木霉ATCC74058 染色体骨架5 和绿色木霉Gv29-8 染色体骨架22 上。 关键词：棘孢木霉；小分子疏水蛋白；基因克隆；生物信息学；序列分析 中图分类号：S763.15 文献标志码：A 论文编号：2012-2373 CloningandSequenceAnalysisofSmallMolecularHydrophobinProteinhyb2Gene fromTrichodermaasperellumT4 Gulijimila ·Mijiti, Fan Haijuan, Liu Zhihua, Wang Na, Dou Kai, Huang Ying, Wang Zhiying (CollegeofForestProtectionNortheastForestryUniversity, Harbin 150040) Abstract: In order to investigate the function of Small molecular hydrophobin protein hyb2 in biocontrol fugi Trichoderma asperellum T4, the series of primers were designed based on the known cDNA fragments of small molecular hydrophobin protein hyb2, with the total RNA and the genome DNA extracted from Trichoderma asperellum T4 as the template, using PCR method, the full length cDNA and DNA sequence of hyb2 gene finally were obtained, their accession numbers were JX014433, JX185070, respectively. The cDNA sequence of hyb2 was 321 bp in length, encoding 106 amino acids. BlastP search indicated that hy