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利什曼原虫去乙酰化酶sir2的序列分析和结构预测第一组 - abc
利什曼原虫去乙酰化酶SIR2的序列分析和
结构预测
Sequence analysis and structure prediction of SIR2 in leishmania
第一组:左云云
单兴娜
李建秋
陈新新
2013.6.21
报告内容
1、背景知识介绍及研究的目的意义
2、SIR2的进化分析,构建发育树
3、SIR2的核酸序列分析
4、SIR2的蛋白序列分析及结构预测
利什曼原虫病
利什曼病(Leishmaniasis)又名利什曼原
虫病。是由利什曼原虫(Leishmania)寄生在
人和犬、野生动物、爬行类动物中的一种
常见的寄生虫病。该病能引起皮肤或内脏
器官的严重损害甚至坏死。该病在大多数
地区是人兽共患病。在不同国家与地区流
行的利什曼病,其主要侵害部位不同.引起
我国利什曼原虫病的病原是杜氏利什曼原
虫。主要引起皮肤黑热病和内脏利什曼原
虫病。
疾病病原
利什曼原虫与锥虫同属一个科,即锥虫科
(Trypanosomatidae)。利什曼原虫随着生活史
的不同阶段而表现出不同的形态。按其生活史
的共同特点有前鞭毛体(Promastigote)和无鞭
毛体(amastigote)两个时期,前鞭毛体寄生在
无脊椎动物的消化道内,其宿主为白蛉(Phl
ebotomusSpp.) 。无鞭毛体寄生在脊椎动物的
网状内皮细胞内,其宿主为哺乳类和爬行类动
物。
人兽共患机制
内脏利什曼病或黑热病病原贮藏在家犬体
内。再由犬类传给人类,成为人兽共传的
传染病。
SIR2的背景知识介绍及研究的目的意义
SIR2 (silence information regulator)基因家族是
一种保守的从古细菌到哺乳动物都存在的NAD+
依赖的组蛋白/ 非组蛋白去乙酰化酶。在酵母中,
SIR2连同与它相互作用的几个蛋白质在基因沉默、
基因组稳定性、细胞寿命以及代谢调节上起着不
可缺少的作用。在哺乳动物中,有7 个SIR2 同源
基因,分别命名为SIRT1 到SIRT7。
SIR2催化的去乙酰反应方程式:NAD+ 乙酰化赖
氨酸→ 烟酰胺+ 乙酰-ADP-核糖+去乙酰化的赖
氨酸
参考生物-酿酒酵母
酵母SIR2 由两个结构域组成,大的结构域由6 个a
螺旋和6 个平行b 折叠组成,小的结构域由3 个反
平行b 折叠,2 个a 螺旋和1 个锌原子组成;另外
还有一系列环状结构与这两个结构域相连,并在其
核心区域的中间形成一个裂缝。
乙酰化的赖氨酸残基和辅助因子NAD+ 结合在裂缝
的对面。
SIR2 核心区域高度的序列保守性,暗示其保守的
催化机制。
目的意义
寄生虫中这类蛋白研究较少。
利用生物信息软件分析利什曼原虫SIR2蛋
白的相关序列和预测其蛋白结构,并分析
SIR2蛋白与底物结合位点与特点,根据作
用靶点找出其抑制剂,应用于抗虫药物研
究。
2、SIR2的进化分析,构建发育树
3、SIR2的核酸序列分析
位于第26号染色体,从55441-56562,共
1121个碱基
没有内含子
所在
位置
密码子使用分析cusp:
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