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真菌感染第五组-20130326
II回顾:尸检的分子检测: 实验分析结果: II回顾:尸检的分子检测: 实验分析结果: 回顾性诊断 NZM ( 非接合菌 ) ZM ( 接合菌 ) MNOS ( 非其他特殊类 ) MY ( 单型酵母菌 ) DY ( 双相型酵母菌 ) 组织切片 35 (1例混合真菌感染) 3 (1例混合真菌感染) 5 1 6 差异性鉴定 1 (1例混合真菌感染) 2 (1例混合真菌感染) 5 0 1 Contents 1 2 3 4 5 几个概念 摘要 第一部分 问答 第二部分 Company LOGO Development and Evaluation of Nucleic Acid-Based Techniquesfor an Auxiliary Diagnosis of Invasive Fungal Infections inFormalin-Fixed and Paraffin-Embedded(FFPE)Tissues 第二组全体同学 核酸技术辅助诊断福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织侵入性真菌感染的发展和评价 Contents 1 2 3 4 5 几个概念 摘要 第一部分 问答 第二部分 Contents 1 2 3 4 5 几个概念 摘要 第一部分 问答 第二部分 福尔马林固定石蜡包埋组织 (FFPE Tissue) 以福尔马林为固定液(有利于组织着色),以石蜡浸入组织起到支持作用而制成的显微切片。 原位杂交(in situ hybridization) 将标记的核酸探针 (probe)与细胞或组织中的核酸进行杂交。 几个概念 ISH流程 1.探针合成 2.组织细胞标本制备 3.ISH试剂配制 4.操作: (1)杂交前处理 (2)预杂交 (3)杂交 (4)杂交后漂洗 (5)杂交后检测 (6)结果判断 最重要? Contents 1 2 3 4 5 几个概念 摘要 第一部分 问答 第二部分 摘要 背景 组织病理诊断 ——金标准; 镜下真菌分辨 ——易致误诊; ISH—— 诊断真菌感染:一种很好的辅助诊断方法 结论 肽核酸探针 (PNA probes)是一种很有效的检真菌方法。 为增加准确性:联合应用组织病理检验和分子探测技术。 内容 用ISH诊断真菌感染; 尸检的分子检测。 Contents Your Slogan here 1 2 3 4 5 几个概念 摘要 第一部分 问答 第二部分 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 历史: ISH的基本原理: 探针(probe)的种类: 几种探针: 几种目标序列: ISH的局限性: I回顾:原位杂交诊断真菌感染 一.历史: ISH第一次被用于诊断 真菌感染,是在20年前。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 二.ISH的基本原理: 被标记的探针和互补的目标rRNA或基因 特异性杂交(配对),使显微切片上的真菌被 着色。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 三.探针(probe)的种类: (1)传统核酸探针: 寡核苷酸探针, 双链DNA探针。 (2)人工合成探针: 肽核酸探针(PNA), 锁核酸探针(LNA)。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 四.几种探针: (1)肽核酸探针(PNA): 例:基于PNA的特异性rRNA探针对区别念珠菌属很有用。 化学本质:一种核酸类似物。 特殊结构:重复甘氨酸单元构成的中性聚酰胺骨架(而核酸是带负电的磷酸糖骨架)。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 四.几种探针: (1)肽核酸探针(PNA): 优势: 由于其骨架的特殊性,PNA可以更快速并且高特异性的和互补的核酸杂交。 相较于传统的血培养标本,在FFPE标本上,PNA所需的杂交次数更少,效率很高,检测周期缩短。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 四.几种探针: (2)锁核酸探针(LNA): 例:双荧光标记的LNA探针对区别镰刀菌属和曲霉菌属很有效。 化学本质:一种RNA衍生物。 特殊结构:核糖环的2P-oxygen和4P-carbon被一个亚甲基连接(一般的核糖环没有被连接)。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 四.几种探针: (2)锁核酸探针(LNA): 优势: 同样的序列数目下,LNA探针相比于DNA探针,可以产生更强的信号。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 四.几种探针: ↓ 目标? 五.几种目标序列: 1.rRNA; 2.DNA。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 五.几种目标序列: 1.rRNA: 优势: 对近似微生物的良好区分效果; 真菌本身有着高拷贝数的rRNA基因,因此真菌可以转录出很多rRNA。 I回顾:原位杂交诊断真菌感染 五.几种目标序列: 1.rRNA: 劣势: 真菌中有大量rRNA酶,容易将rRNA降解,而且FFPE标本上的rRNA酶
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