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2012-5-16 承担单位:福建省农科院农业生物资源研究所 试验设计
2012-5-16
承担单位:福建省农科院农业生物资源研究所
试验设计:
试验项目:胰蛋白酶活化后Bt、BA与小菜蛾BBMV
研究资格系数 (0.5-1.0) 实验设计系数 (0.9-1.0) 报告得分 总分 实验设计 实验记载 实验分析 实验简报 实验文章 1-20% 21-40% 41-60% 61-80% 81-100% 1%-5%
设计,实施实验,记载,分析清晰,结论清晰文献完整,发表水平
福建省农业科学院农业生物资源研究所
农业微生物研究中心
电话: 0591 传真: 05911.试验目的
Octet RED System 蛋白互相作用系统是应用专利的BLI(Bio-Layer Interferometry)技术,即生物膜层表面干涉技术进行精确检测。此技术用光纤制成的生物传感器底端覆盖了生物分子相容层,用来固定相互作用分子中的一个,形成生物膜层。相互作用发生时,生物层厚度增加,反射光干涉光谱曲线整体向波长增加方向移动。分子结合或解离时,都会导致干涉曲线的漂移。Octet RED System可进行定量分析(分子之间有无结合,结合的量有多少),动力学和亲和性分析,结合能力和结合的协同性(结合速率Ka,解离速率Kd,结合常数KD)等。它广泛地应用于抗原—抗体、蛋白质分子之间以及药物—蛋白质、受体—配体、DNA与蛋白质之间、核酸—核酸等相互作用的研究中。2010年,Eric Bourhis 等在JBC上发表了”Reconstitution of a Frizzled8-Wnt3a-LRP6 signaling complex reveals multiple Wnt and Dkk1 binding sites on LRP6”,其中hLRP6 和 mFz8 CRD-Fc 与 FA 及 AHC的结合动力学研究中就应用了Octet Red 技术。Octet Red 技术具有操作简单,分析速度快,准确度高(CV值10%),灵敏度高(可检测小至150Da的分子)等特点。它可以计算结合速率常数和解离速率常数等动力学常数。研究利用Octet Red 技术进行中肠蛋白与Bt晶体蛋白及藕合BTA的结合动力学研究,研究BT晶体与藕合BTA与中肠结合活性,并对BT与BTA的作用机理进行比较。研究利用Octet Red 技术2.试验
2.1.1试剂
50mM,PH 10,生物素标记蛋白,Bt晶体(等电点提纯),EDC,NHS,羧基化的阿维菌素(AVM-COOH),DMF,PBS,中肠提取液(BBMVs-buffer),超滤管,离心机,0.25%胰蛋白酶,0:0.8丙烯酰胺/双丙烯酰胺,蒸馏水,分离胶缓冲液,10%APS,TEMED,浓缩胶缓冲液,folin-酚试剂盒。
2.1.2试验器具及仪器Mm Tris-HCl pH 7.5
用中肠提取液溶解中肠,捣碎后,离心取上清,得到中肠粗提物。
2.3.6 用bradford法测定Cry毒素,BtA毒素,中肠蛋白浓度。
在96孔板中将牛血清蛋白(BSA)母液倍比稀释为500 μg/ml, 250 μg/ml,125 μg/ml, 62.5 μg/ml,31.25 μg/ml 5个梯度每孔各50 μl,同时加入50 μl Cry毒素,BtA毒素,中肠蛋白。每孔加入200 μl考马斯亮蓝,静置20分钟后,用酶标仪测得每孔在波长595nm处的吸光值。
2.3.7 将中肠蛋白倍比稀释为16x,8x,4x,2x,1x共5个浓度梯度。
2.3.8上样
Cry毒素与BBMVs结合反应,按下表进行上样
1(Baseline)
2(loading)
3(baseline 2)
4(association)
5(dissociation)
A
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(16x)
PBS
B
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(8x)
PBS
C
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(4x)
PBS
D
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(2x)
PBS
E
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(1x)
PBS
F
PBS
Cry-SA
PBS
PBS
PBS
图1
各个阶段反应时间如图1所示。
BtA与BBMVs进行反应,按下表进行上样,
1(baseline)
2(loading)
3(baseline 2)
4(association)
5(dissociation)
A
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(16x)
PBS
B
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(8x)
PBS
C
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(4x)
PBS
D
PBS
Cry-SA
PBS
BBMVs(2x)
PBS
E
P
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