土壤中抗生素抗性基因丰度不断增加.PDF

土壤中抗生素抗性基因丰度不断增加 C.W. Knapp, J. Dolfing, P.A.I Ehlert, et al. 前言 因传递或其他机制将对抗生物的抗性传递给病原 体。因此评价抗生素和抑菌剂的使用是否已经改 在过去的几十年里，抗生素抗药性 （A R ） 变并持续改变自然中的 “背景”抗性水平，判断 引起了越来越多的关注。抗甲氧西林金黄葡萄球 环境生物体是否有机会将抗性传递给病原体就显 菌 （M R SA ）、抗万古霉素肠球菌 （VRE ）等具 得非常重要了。 有传染性的 “超级细菌”的出现正在威胁着世界 幸运的是，最近的研究发现，档案土壤提取 范围内的健康服务系统。有趣的是，环境微生物 出的DNA为了解历史微生物群落提供了非常有价 （即肠道系统之外的物种）对抗生素化合物的抗 值的信息。在这种理念的指导下，我们获取了荷 性是一个自然现象，特别是在土壤中更是如此； 兰乡村5个长期监测点位1940~2008年间的档案土 然而，至今还不清楚超级细菌的传染性与环境微 壤样品，定量分析了土壤中18种抗性决定子 （包 生物的抗性是什么样的相互关系。例如，尽管 括针对超广谱 β- 内酰胺酶、四环素、红微素和 二次大战以来抗生素和抑菌剂的工业生产显著增 糖肽类抗生素的ARG ）的丰度。尽管ARG并不一 加，但还不清楚自然土壤中的A R 背景值是否发 定实现抗性的表达，但它们能够反映抗性的 “潜 生了变化。这可能是因为环境微生物同时暴露于 力”，这也是唯一可用的标记物，可以比较它们 抑菌剂、重金属以及其他不利环境之中，致病微 在历史样品中丰度的差异并研究长期的变化趋 生物可能会在土壤有机体中为抗性特征提供汇集 势。本研究采用的档案土壤在土壤类型、灌溉水 的场所，这将对公众健康造成更为广泛的不利影 和肥料使用历史、重金属暴露等方面具有差异， 响。虽然不能明确超级细菌与环境有机体之间的 这也为研究A R G水平的影响因素提供了便利条 关系，但将现在土壤中与大范围抗生素工业生产 件。最后测定了微生物16S-rRNA基因水平，用来 之前土壤中AR的水平 （作为研究的初始点）加以 比较采集时土壤中的微生物水平，评价土壤储存 对比也是非常有意义，这也是本研究的基础。 条件对DNA的影响，利用每个土壤中的微生物总 青霉素是最早被广泛使用的一种抗生素 量将ARG水平进行标准化，利于尽心对比分析。 （1928年Alexander Fleming发现），在20世纪40 年代早期实现了大批量生产。随后很快链霉素、 材料与方法 四环素和其他抗生素也进入了工业生产阶段。生 产能力的不断提高以及价格的不断下降促进了抗 采用的档案土壤 土壤样品来源荷兰瓦格宁根 生素在医疗领域之外的应用。例如，研究发现低 大学和研究中心的T A GA土壤档案系统。T A GA 剂量的抗生素能够促进牲畜的生长，因此常被作 系统包括1879年以来多项研究所用的土壤，本研 为预防药剂加入到动物饲料中。随着应用领域的 究采用土壤基本情况见表1 （表略），其地理位置 不断扩大，抑菌剂的生产和使用不断增加。尽管 见图1 （图略）。需要特别强调的是土壤采集的目 还无法准确计算抗生素的年使用量及年生产量，