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第四章蛋白质分析.doc
第四章 蛋白质(Protein)分析
第一节 基础知识
一.概述
蛋白质
——“protein” 由希腊文转 “最原始的”
——蛋白质:
主要由20多种α-氨基酸以肽键(peptide bond)连接而成的(肽链chain)具有确定构像的生物大分子,
此外许多蛋白质还会有一些非氨基酸成份,如糖、脂、核苷酸、磷酸、金属离子等。
辅基(成键),配基(分子间力)
性质:
分子量从数千――数百万
是生物体重要组成部分,重量上占细胞干重的一半以上,肌肉、皮肤、血液、毛发重要成份
功能上参与几乎所有的生命活动过程,
酶、运输蛋白、防御蛋白、激素蛋白、毒蛋白、受体运动蛋白、结构蛋白
种类 估计1010-1012种
二.结构
蛋白质结构异常复杂,分为四级描述
(一)一级结构(primary structure)
指肽链中的氨基酸排列顺序(序列),也包括二硫键的定位。(蛋白质结构的基础)
1.肽键 peptide bond
结构式
R1 H R1 O H
? ? ? ?? ?
NH2?C?COOH + NH2?C?COOH ? NH2?C?C—N—C—COOH
? ? ? ? ?
H R2 H H R2
羧基 氨基 肽键
不同氨基酸首尾相接
一般肽键反式结构
肽链 peptide chain
——由肽键连接而成多氨基酸链
——结构式
R1 O H O R3
? ?? ? ?? ?
NH2?C—C—N—C—C—N—C—COOH
? ? ? ? ?
H H R2 H H
N端残基 残基 C端残基
形成肽键后,氨基酸失水成为“氨基酸残基” residue
“链中氨基酸单元”
结构式习惯写法
N端在左
C端在右
多肽 (polypeptide)
2个氨基酸残基 肽链 二肽
3个氨基酸残基 肽链 三肽
〉〉10-12氨基酸残基 肽链 多肽
〉数十氨基酸残基 肽链 蛋白质
蛋白质≥多肽
二硫键 disulphide bond
①形成
NH2
?
H??C??CH2SH
?
COOH
半胱氨酸 Cysteine (Cys)分子中两SH在碱性pH下,易氧化成硫-硫键(二硫键)
结构图
—SH + —SH + O2 ? —S—S— + H2O
②种类
链内二硫键 同一肽链内Cys间
链间二硫键 不同肽链内Cys间
5.蛋白质一级结构
牛胰岛素肽链结构图
1953年,英国Sanger测序 5700MW
中国 6年9个月 1965年首先合成结晶胰岛素
二级结构 (Secondary structure)C=O 形成氢键
③β-折叠 片结构(pleated sheet structure))
(四)四级结构 (quaternary structure) 4.也有蛋白仅有一个肽链,结构仅到三级结构为止
结构性质
1.一级结构(化学键)是基础
——高级结构取决于一级结构?
——不同一级结构,高级结构不同;
——同一级结构,高级结构同?
二、三、四――高级结构
——决定外形,内部结构,
——蛋白活性,功能,直接关系,一级结构 共价键
蛋白质高级结构,具有稳定性,可变性
稳定性――非共价键分子间作用力,氢键,离子键。
疏水性,范德华力等,1/90 共价键
可变性――活性改变,
——化学反应
——易变性:热,紫外线,酸碱,表面活
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