微丝相关蛋白hspc300／hhbrk1与肌球蛋白ⅵ 相互 - 上海大学学报.pdfVIP

第１６卷 第６期 上 海 大 学 学 报 （自然 科 学 版） Ｖｏｌ．１６Ｎｏ．６ ２０１０年１２月 ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＳＨＡＮＧＨＡＩＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ（ＮＡＴＵＲＡＬＳＣＩＥＮＣＥ） Ｄｅｃ．２０１０ 　　ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７２８６１．２０１０．０６．０１６　 微丝相关蛋白ＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１与肌球蛋白Ⅵ 相互作用位点的计算机预测 王飞飞，　薛晓怡，　王翼飞 （上海大学 理学院，上海２００４４４） 摘要：ＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１蛋白作为ＢＲＫ１的人类同源蛋白，参与细胞运动和物质运输．肌球蛋白 是肌球蛋白家族 Ⅵ 的成员．ＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１和肌球蛋白 共同定位于细胞的胞浆，ｈＨＢＲＫ１可能通过与肌球蛋白 相互作用，参与 Ⅵ Ⅵ 细胞内的物质运输．从结构角度出发，通过计算机模拟蛋白质间相互作用，预测二者作用区域，找出相关残基 ＰＨＥ４３，ＬＹＳ１０５，ＴＨＲ６７６和ＬＥＵ４０，即可能成为相互作用位点的重要残基，为进一步实验研究提供了重要信息． 关键词：ＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１；肌球蛋白 ；结构预测；分子间对接 Ⅵ 中图分类号：Ｑ８１　　　　　　文献标志码：Ａ　　　　　　文章编号：１００７２８６１（２０１０）０６０６３５０４　 ＣｏｍｐｕｔｅｒＰｒｅｄｉｃｔｉｏｎｏｆＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１Ｐｒｏｔｅｉｎａｎｄ Ｍｙｏｓｉｎ ＰｒｏｔｅｉｎＩｎｔｅｒａｃｔｉｏｎＳｉｔｅｓ Ⅵ ＷＡＮＧＦｅｉｆｅｉ，　ＸＵＥＸｉａｏｙｉ，　ＷＡＮＧＹｉｆｅｉ （ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＳｈａｎｇｈａｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｓｈａｎｇｈａｉ２００４４４，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１ｐｒｏｔｅｉｎｉｎｖｏｌｖｅｄｉｎｃｅｌｌｍｏｖｅｍｅｎｔａｎｄｍａｔｅｒｉａｌｔｒａｎｓｐｏｒｔｉｓａｋｉｎｄｏｆ ｈｕｍａｎｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓｐｒｏｔｅｉｎｓ．Ｍｙｏｓｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎｉｓａｍｅｍｂｅｒｏｆｔｈｅｍｙｏｓｉｎｆａｍｉｌｙ．Ｉｔｉｓｐｏｓｓｉｂｌｅｔｈａｔ Ⅵ ＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１ｐｒｏｔｅｉｎａｎｄｍｙｏｓｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎｒｅａｃｔｆｏｒｔｈｅｒｅａｓｏｎｔｈａｔｔｈｅｙａｒｅｐｒｅｓｅｎｔｉｎｔｈｅ Ⅵ ｃｙｔｏｐｌａｓｍｏｆｃｅｌｌｓａｎｄｔｈｅｙａｒｅｂｏｔｈｉｎｖｏｌｖｅｄｉｎｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒｔｒａｎｓｐｏｒｔｏｆｔｈｅｍａｔｅｒｉａｌ．Ｔｏｌａｙａｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ ｆｏｒｆｕｒｔｈｅｒｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔｓ，ｗｅｐｒｅｄｉｃｔｔｈｅａｒｅａｏｆｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｕｎｄｅｒｔｈｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌｐｏｉｎｔｂｙｃｏｍｐｕｔｅｒ ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎｏｆｐｒｏｔｅｉｎｐｒｏｔｅｉｎｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ，ａｎｄｆｉｎｄｔｈｅｒｅｌａｔｅｄｒｅｓｉｄｕｅｓｔｈａｔｍａｙｂｅｃｏｍｅｔｈｅｓｉｔｅｓｏｆａｍｉｎｏ ａｃｉｄｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ：ＰＨＥ４３，ＬＹＳ１０５，ＴＨＲ６７６ａｎｄＬＥＵ４０． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ＨＳＰＣ３００／ｈＨＢＲＫ１；ｍｙｏｓｉｎ ；ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ；ｄｏｃｋｉｎｇ Ⅵ