基于群体分化指数犉牦犜的绵羊全基因组选择信号检测.pdf

畜牧兽医学报 ， （ ）： １８９１１８９９ 　 犃犮狋犪犞犲狋犲狉犻狀犪狉犻犪犲狋犣狅狅狋犲犮犺狀犻犮犪犛犻狀犻犮犪 ： ／ ｄｏｉ１０．１１８４３ ．ｉｓｓｎ．０３６６６９６４．２０１３．１２．００５ ｊ 基于群体分化指数 的 犉 犛犜 绵羊全基因组选择信号检测 ， ， １２ ２ ２ ２３ ２ ２ １ １ ２ 曾 滔 ，赵福平 ，王光凯 ，吴明明 ，魏彩虹 ，张 莉 ，李 利 ，张红平 ，杜立新 　 　 　 （ 四川农业大学动物科技学院，雅安 ； 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 ； １． ６２５０１４ ２． １００１９３ ３．中国农业大学动物科技学院，北京 １００１９３） 摘 要：本研究基于苏尼特羊（ ）、德国肉用美利奴羊（ ）和杜泊羊（ ） 个群体的 狀＝６６ 狀＝１５９ 狀＝９３３ ＩｌｌｕｍｉｎａＯｖｉｎｅ 　 ＳＮＰ５０芯片分型数据，借助群体分化指数 犉 法进行群体间选择信号的检测分析，应用生物信息学方法分析寻找 犛犜 选择信号区域内的重要基因。结果，共找到 ３４３个“离群”位点，通过基因注释找到这些位点对应的 ３６５个候选基 因。其中部分基因与绵羊生长、繁殖及肉质性状相关，如 、 、 、 、 等，本研究 犐犌犉２ＰＢ３犐犌犉１Ｒ犅犕犘２犅犕犘犚１Ｂ犆犃犘犖３ 结果也进一步验证了前期利用 和 研究检测到的基因结果。通过 分析发现，这些基因主要富集在 ＣＮＶ ＧＷＡＳ ＧＯ 新陈代谢和去甲基化等条目。通过群体分化指数 犉 能有效地检测到具有选择信号的基因，其中包括绵羊部分重 犛犜 要经济性状的候选基因，研究结果能为绵羊的育种提供参考。 关键词：绵羊基因组；选择信号；候选基因；群体分化指数（ ） 犉 犛犜 中图分类号： ； 文献标志码： 文章编号： （ ） Ｓ８２６Ｓ８１３．１ Ａ ０３６６６９６４２０１３１２１８９１０９ 　　　　 　　　　 犌犲狀狅犿犲狑犻犱犲犇犲狋犲犮狋犻狅狀狅犳犛犲犾犲犮狋犻狅狀犛犻狀犪狋狌狉犲狊犻狀犛犺犲犲 犘狅狌犾犪狋犻狅狀狊狑犻狋犺 犵 狆 狆 犝狊犲狅犳犘狅狌犾犪狋犻狅狀犇犻犳犳犲狉犲狀狋犻犪狋犻狅狀犐狀犱犲狓犉