环境基因组学：研究除草剂2，4-D的毒性和抗性机制.PPT

环境基因组学：研究除草剂2，4-D的毒性和抗性机制 报告人：禤淑霞 摘要 前沿 用酵母模型来阐明基因-环境的相互作用 用植物模型来阐明基因-环境的相互作用 总结与展望 摘要 利用基因组学的信息和工具，能够更好的理解各种有机体与周围的环境的相互作用。在这里，我们揭示了环境基因组学这个新的领域如何研究2,4-D氯化苯氧乙酸除草剂(2,4-D 氯化苯氧乙酸)的毒理作用机制和抗性的基本原理。 2,4-D是最成功和最广泛使用的除草剂之一，但它的过度使用已经导致杂草抗药性的增加，而且当使用浓度高于推荐浓度的时候也引发了一些毒物学的问题。这篇综述以酿酒酵母和拟南芥两种模式生物来展开关于2,4-D的毒性和相应的反应。 前言 2,4-D的广泛和高强度的使用可能导致一些毒物学的和环境的问题，而且已经导致出现了抗药性增加的杂草（造成重大的经济损失，威胁环境和人类健康） 利用酿酒酵母和拟南芥两种模式生物，并结合了基因-基因的方法，研究2，4-D毒性作用机制和适应反应。在一个细胞或组织的DNA（基因型），RNA（转录组学），蛋白质（蛋白质组学）和代谢物（代谢组学）水平上，研究所有基因的表达与毒物的响应，这种新的毒性系统论方法被认为是毒理基因组学。 这种新的各学科间交叉的领域把新的技术和研究病理学和毒物学的较传统的工具结合起来，进而研究在环境压力下生物的反应。生物学系统方法论提供了一个空前有力的工具来直接监控毒物学的最早期的反应 。通过微阵列或表达蛋白质组学，在几乎一出现毒物反应时就能检测出发生变化的全部基因的表达。而毒性的临床反应可能会几天甚至几年才表现出来。因此，比起传统的毒物学方法，评估这些基因表达的改变可能提供一个更早更灵敏的毒性反应的生物标记。 用酵母和植物模型来阐明基因-环境的相互作用 真核模型系统的开发有助于人们了解对环境刺激对人类健康所产生的影响。由于很多信号途径和它们的分子组成成分充分保留在模式真核生物中，这些模型系统也成功解释化学分子在这些基本途径中的表达和功能。大量的模式系统改进了高质量高通量的基因组工具和增加了数据库。 酿酒酵母是单细胞的真核模型，具有非致病性，便宜，容易进行遗传操作，好的特性以及快速生长率等特点 。借助于简单可用的数据库和几年的后基因组研究也收集了大量的生物学信息 拟南芥的小型，快速生活周期和多种子产量使得人们关注并研究了它的强烈的遗传性，生化和生理超过40年，从而为实验室操作和培养提供了有利条件 。大量的基因组资源使得拟南芥可以对植物在非生命的压力时的反应进行系统选择的分子和系统广泛的研究 酵母对2，4-D的全面反应，评估2，4-D的毒性 通过多药物抵抗和细胞外被膜重排来解毒 细胞内酸化和pH恢复 强氧化剂反应和抗氧化性反应 一般胁迫应激反应 营养限制的感应和反应：TOR途径的作用 拟南芥对2,4-D应激反应 除草剂2,4-D作用的模型 分子机制研究 通过多药耐药运输来解毒 细胞内pH恢复和膜或细胞壁改变 普通压力应激 TOR途径 图3，酵母对2,4-D适应性反应的模式。(a) 刺激反应的H+-ATPases出现在质膜和液泡膜中。(b) 抗氧化防卫活化。(c) 基因转录活化编码多药物运输，推定涉及除草剂抗衡离子的主动运输，细胞壁和质膜重排。(d)通过TOR途径进行选择性营养新陈代谢的活化作用 在低pH环境中，高亲脂弱酸性的2，4-D呈现未解离的亲脂毒性状态（RCOOH），因此经由被动扩散能容易地通过质膜。在中性的细胞溶质中，2，4-D的非解离形式分解，导致细胞内酸化和毒性抗衡离子的堆积（RCOO?），而不能轻易的通过质膜脂质双分子层。因此，低的pH值（例如酸性土壤，动物消化道）会显著的引起除草剂的毒性。 在酵母中，多重抗药性质膜转运属于扩散载体超家族(MFS)或ATP结合盒 (ABC) 超家族，给予药物和其他化学应力组成的抗性，可能是促进了它们的非亲脂性状态的转变。在MDR家族中Tpo1p和Pdr5p（分别属于MFS和ABC超家族）的参与酵母对2，4-D的抗性的基础上，假设这些质膜运输促进了2,4-D抗衡离子的主动运输。对2,4-D 起抗性的酵母9个基因[编码MDR运输和由相同的多重药物抗性（PDR）调整网络控制]进行了微阵列分析 ，发现只有TPO1和PDR5能确定在对除草剂的抗性中起到决定性作用。 在2,4-D 刺激下一些基因（包括细胞壁重塑）上调。这些包括SPI1编码减少壁孔和亲脂性2,4-D通过质膜的细胞壁蛋白的表达。在质膜组成水平上的改变，包括增加了膜脂肪酸的饱和度。这些适应性机制保护膜脂氧化，对于生物膜的流动性和功能有深刻的影响。由OLE1编码的Δ9脂肪酸去饱和酶减少转录（催化饱和脂肪酸与不饱和脂肪酸的转化），以适应2,4-D 细胞内的酸化可能抑制大量生物反应，特别是H+依赖的跨