9代谢组学.pptVIP

* 第二，NMR制谱 适合研究代谢产物中的成分、表征和研究海量的代谢信息及其变化规律，从而得到丰富的生理、病理、药理和毒理等生物信息。 其中1HNMR对含氢化合物均有响应，能给出精细的代谢物成分图谱即代谢物指纹图谱。 * 不同器官组织具有不同的代谢轮廓，广谱全采集 * 第三，数据预处理 原始NMR谱图往往由于溶剂峰、溶剂峰压制后的残余峰和基线畸变等因素的影响而不能直接拿来做多元数据统计分析，因此，通常需要对NMR谱进行预处理。 预处理 NMR谱图去噪、溶剂峰消除、调相与基线校正 NMR谱图分段积分 归一化;标准化 数据预处理包括行处理(针对单个样本)与列处理(针对所有样本的某一个变量)。 行处理在前，剔除一些对数据分析没有意义的变量 列处理在后，针对保留下来的变量根据要求进行变换 * 第四，特征代谢物识别和生物分析 代谢组学的最后一步，也是关键步骤之一。利用模式识别方法(如PCA)得到特征变量，通过对这些变量的分析研究并结合NMR谱图归属信息，就可以获得全面的代谢物信息及代谢紊乱标记物。 根据已知的特征代谢物，结合生物、化学、医学手段可以进行疾病诊断，药理分析和药物毒性跟踪 * 步骤总结如下： * 代谢组学各分析流程技术 * * * 代谢组学的应用 代谢组学自从出现以来，引起了各国科学家的极大的兴趣，广泛地应用于各个领域，如毒性研究、药物开发、疾病诊断、植物代谢组学等方面的研究中。 目前代谢组学已经成功用于早期脑肿瘤、早老性痴呆、心血管疾病、癌症和糖尿病等疾病的诊断和分型。 代谢组学研究“代谢指纹图谱” 不仅研究药物本身的代谢变化,而主要是研究药物引起的内源性代谢物的变化，更直接反映体内生物化学过程和状态的变化 揭示的生物化学变化很容易与传统手段的测定结果联系，更容易评价药效作用和发现药物作用的生物化学物质基础和作用机制 作为一种体内药物安全性评价的方法，代谢组学方法能比传统方法更快、更准确地发现毒性物质和毒性规律。 * 吴晓晖（Wu, Xiaohui）博士 E-mail: xiaohui_wu@fudan.edu.cn? 1972年生，1990年进入复旦大学遗传学专业本科学习， 1994年获准提前攻读复旦大学遗传学研究所研究生 1997-2000年间赴美国耶鲁大学联合培养 1995年和2001年分别获得学士和博士学位 2001年留校到发育生物学研究所工作，历任讲师、副教授、教授、博导 2008年起任复旦大学特聘教授。目前兼任中国遗传学会发育遗传学委员会委员，上海市遗传学会理事，上海市杨浦区政协委员。 主要研究方向 (Research Interests) ?长期致力于开发新的哺乳动物遗传学研究方法，培育并利用基因突变动物研究和发育与疾病机理。 在世界上首创了哺乳动物PB转座子系统，为大规模转基因和基因诱变提供了高效便捷的工具。 在此基础上，培育了小鼠基因突变体5,000余种，建立了规模世界领先的小鼠基因突变体和疾病模型资源。 建立了小鼠17号染色体全长有丝分裂重组系统，并用小鼠和果蝇开展了肿瘤、神经和肌肉退行性疾病等多种疾病机理和动物模型研究。 目前，本研究组主要利用基因突变小鼠结合细胞和生化方法研究代谢异常和肾脏发育机理。 * 系统生物学是后基因组研究最具挑战 性的一个研究领域。它包括转录组、蛋白质组、 代谢组学分析等分子生物学研究，数学分析，计 算机应用，模型建立和仿真等诸多方面的研究内 容 * 1应用于植物生理和微生物领域的研究 ,但也有应用于动物组织和细胞的，以GC/MS 为主, 2主要利用核磁共振技术和模式识别方法对生物体液和组织进行系 统测量和分析,对完整的生物体(而不是单个细胞) 中随时间改变的代谢物进行动态跟踪 检测、定量和分类,然后将这些代谢信息与病理生理过程中的生物学事件关联起来,从而 确定发生这些变化的靶器官和作用位点,进而确定相关的生物标志物 1应用于植物生理和微生物领域的研究 ,但也有应用于动物组织和细胞的，以GC/MS 为主, 2主要利用核磁共振技术和模式识别方法对生物体液和组织进行系 统测量和分析,对完整的生物体(而不是单个细胞) 中随时间改变的代谢物进行动态跟踪 检测、定量和分类,然后将这些代谢信息与病理生理过程中的生物学事件关联起来,从而 确定发生这些变化的靶器官和作用位点,进而确定相关的生物标志物 1应用于植物生理和微生物领域的研究 ,但也有应用于动物组织和细胞的，以GC/MS 为主, 2主要利用核磁共振技术和模式识别方法对生物体液和组织进行系 统测量和分析,对完整的生物体(而不是单个细胞) 中随时间改变的代谢物进行动态跟踪 检测、定量和分类,然后将这些代谢信息与病理生理过程中的生物学事件关联起来,从而 确定发生这些变化的靶器官和作用位点,进而确定相关的生物标志物 * This