CPSARST 高效能蛋白质环状重组搜寻引擎之原理及其应用於蛋白质.PDF

CPSARST高效能蛋白質環狀重組搜尋引擎之原理及其應用於蛋白質特 技術 名稱 殊結構關連性之偵測 呂平江教授 (生醫) 生物資訊與結構生物研究所 Keyword: 蛋白質環狀重組、蛋白質結構比對 發明者 E-mail: d914226@.tw Phone: 0911894906 , Fax: 03-5715934 Website: .tw/cpsarst 蛋白質的環狀重組變異 (CP)相當於其 N和 C 末端被接在一起，並在另一處產生開 口。具 CP關係的蛋白質間，結構與功能通常相似，此特性已被用於增進酵素活性 技術 或結構穩定性，並生產具特殊性質的 sensor 。我們開發了高效能的CP搜尋工具 內容 CPSARST 。過去的方法需數週才能掃瞄完蛋白質結構資料庫, CPSARST僅需兩分 鐘。此高效能有助於快速分析蛋白質結構間的特殊關係，並累積大量 CP 切割點資 料，以研發切割點預測工具，進而加速CP 於蛋白質科技及工業領域之應用。 技術 特色 1. 偵測蛋白質間的環狀序列重組關係 CPSARST能快速且準確地偵測蛋白質間的環狀序列重組關係，並提供結構重疊 結果與環形序列比對。 2. 有助新穎蛋白質之功能預測 當人們發現了新的蛋白質卻無法以一般結構搜尋比對工具判定或預測其功能 時， CPSARST可適時派上用場，如果該蛋白質與其他結構已知之蛋白質間存在 CP關係，則該已知蛋白之功能便可為預測時的參考。 3. 準確分析古老的蛋白質親緣關係 具有環形序列重組關係的蛋白質間序列相似度往往甚低，用一般比對方法不易分 析其親緣關係，CPSARST所提供的環形序列比對可解決這項難題。 4. 加速環形重組蛋白於蛋白質工程上的應用 CPSARST可精準計算蛋白質發生過環形序列重組的位置。這類資訊的累積有助 人們減少自行設計環形重組蛋白時耗費在嘗試錯誤上的時間與金錢。 應用 蛋白質工程、蛋白質藥物設計、新穎蛋白質之功能預測 範圍 專利名稱 證書號 發明人 衍生 CPSARST—高效能蛋白質環形序列重 TW(申請中 ) 羅惟正 專利 組搜尋比對工具 呂平江