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第一章生物有机质和沉积有机质
CHO (CHOH)4 CH2OH 碳水化合物也称醣,是由多羟基醛或多 羟基酮及它们的衍生物构成的有机质。 由碳、氢、氧三种元素按一个C、一个水 (2H、1O)的比例组成,故称碳水化合物。 一、碳水化合物(Carbohydrate) (1)单糖:最简单的糖分子是单糖。 1.碳水化合物的组成类型 甘油醛 二羟基丙酮 果糖 葡萄糖 (2)低聚糖 二糖至十糖 单糖可通过脱水缩合作用而结合在一起,缩合作用通常在两个单糖分子的羟基之间发生,从而形成苷键。二个单糖缩合的产物称为二糖,如蔗糖,它含有一个葡萄糖和一个果糖单元,更多的单糖分子缩合形成三糖、四糖等。 乳糖 β-型 麦芽糖 β-型 棉子糖 蔗糖 苷羟基 注意:多糖并不是一种纯粹的有机化合物,而是聚合程度较高 的混合物。 多糖中对形成沉积岩中有机质最有意义的是纤维素和半 纤维素。 纤维素(Cellulose): 半纤维素: 分子量小于纤维素,是纤维素中-CH2OH为H所取代后的产物。 (3)多糖 定义:由上千个单糖以糖苷键(单糖-O-单糖)相连成的高聚体。 性质: 一般不溶于水,个别的能在水中形成胶体溶液. 在自然界中分布很广。如:植物的骨架—纤维素,植物 储藏的养分—淀粉,动物体内储藏的养分—糖原。 分子量介于50000-400000之间、聚合 程度很高的多醣。 不溶于水,构成植物和某些动物的骨干。 纤维素、半纤维素和木质素总是同时存在于植物的细胞壁中,构成植物支撑组织的基础。 几丁质(Chitin)是单糖和氨基酸的聚合物,可视为乙酰胺基CH3CONH取代了纤维素的两个羟基。 醣在自然界中分布极广,也是一切生物体的重要组成部分之一。 醣是光合作用的产物,它将太阳能储存于生物体内(种子),为生物的生命活动提供了基本的能量,并且构成某些动植物的支撑组织(细胞壁)和抗干燥组织(皮肤)。是合成其它生物有机组分的原料。 2.碳水化合物一般性质 水解性:在水溶液中的细菌作用下由大分子变成小分子 聚合性:在缺氧或在脱水条件下,由小分子聚合成大分子 抗细菌降解性:简单的醣易水解,也易遭受细菌(喜氧或厌 氧)的降解;复杂大分子的醣不易水解, 也不易遭受细菌降解。 二、蛋白质和氨基酸 1. 蛋白质(protein) 由植物合成的、含有肽键的有机质称为蛋白质。 实际上,细胞内除水以外其余80%物质为蛋白质,可见它是生物体内一切组织的基本组成部分、是生命的基础。 蛋白质是含氮的高聚物。除碳、氢、氧及少量的硫、磷外, 含氮量平均为16%。 主要作为支撑组织、保护组织、催化剂、激素、抗体和色素。 蛋白质化学结构 肽键: (1)结构 分解产物氨基酸广泛地存在于不同时代的地质体中,对石 油的形成具有重要的意义。 (2)蛋白质的分布及其地质意义 (3)蛋白质的类型 (4)蛋白质的水解性 地表有机质中蛋白质占1/3-1/4,但由于蛋白质易被分解 所以在古老沉积岩中完整的蛋白质和多肽类却很少。 蛋白质(>6000) 按分子量大小分 肽(分子量<6000) 按分子量的排列方式分 纤维蛋白—不溶于水 结合蛋白—与非氨基酸物质结合 球蛋白—溶于水及酸、碱、盐溶液 蛋白质 水解 多肽 水解 肽 水解 氨基酸 蛋白质水解产物就是氨基酸 氨基酸是组成蛋白质的基本单元 氨基酸是同时含有氨基和羧基的化合物。 氨基酸 2.氨基酸(amino acid) (1)命名和种类 根据氨基与羧基的位置可分为α、β、γ氨基酸。 系统命名法:以氨基为取代基,羧基骨架当作母体来命名。 根据氨基和羧基数量多少,分为 碱性氨基酸—氨基多于羧基 中性氨基酸—氨基等于羧基 酸性氨基酸—氨基少于羧基 (2)氨基酸的一般性质 α氨基酸是白色结晶体,大部分易溶入水,但不溶于有机溶剂。 氨基酸既有所羧基又含碱基,是两性物质。 氨基酸是一类稳定性较高的化合物,熔点较高。 当氨基酸分解同时脱去氨基和羧基就可以形成烃类, 而且大部分烃类是C1-C7轻烃。 据P.Abelson热模拟实验资料,氨基酸有三种变化为: 氨基酸加热后侧链发生变化形成另一种氨基酸; 脱氨基形成有机酸; 脱羧基形成胺类。 据A.Weiss,J.Hunt等人的研究,在缓慢加热氨基酸和蒙脱石的有机粘土络合物时,可以得到链烷烃、环烷烃和芳香烃的混合物。甚至在100~200℃就可以检测出氨基酸形成的烃类。 氨基酸是一种分布极广的有机物,在自然界中。从现代沉积物到古代沉积岩,几乎都有氨基酸的分布。有机体死亡之后,氨基酸保存在各类化石中。氨基酸的含量与沉积介质有明显关系,海相沉积物中比陆相沉积物中氨基酸含量高,并富含精
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