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金花茶查尔酮异构酶基因全长克隆与表达的初步研究 - 林业科学研究
林业科学研究 2012,25(1):93 99
ForestResearch
文章编号:10011498(2012)01009307
金花茶查尔酮异构酶基因全长克隆与表达的初步研究
1,2 1 1
周兴文 ,李纪元 ,范正琪
(1中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江 富阳 311400;2广西玉林师范学院,广西 玉林 537000)
摘要:利用RT-PCR和RACE技术,从我国珍稀濒危植物金花茶花瓣中获得了查尔酮异构酶(Chalconeisomerase,
CHI)基因的cDNA全长,命名为CnCHI,GenBank登录号 HQ2698051。碱基序列分析表明,CnCHI基因全长953
bp,包含56bp的5’非翻译区、204bp的3’非翻译区和一个长为693bp编码230个氨基酸的开放阅读框。氨基酸
序列比对分析表明,CnCHI基因编码蛋白与蔷薇科、杜鹃花科、茄科等植物的CHI蛋白同源性都在75%以上,与山
茶科山茶属茶树CHI蛋白同源性高达99%。相对荧光定量PCR分析表明,CnCHI基因在金花茶花蕾发育过程中
呈现先急剧上升后平缓下降的趋势;在花器官的不同部位中,CnCHI基因表达量最高的是雌蕊,其次是雄蕊,在萼
片和花瓣中的表达量较低且相差不大。
关键词:金花茶;查尔酮异构酶基因;序列分析;相对定量PCR;表达特性
中图分类号:S71846 文献标识码:A
CloningandExpressionAnalysisofChalconeIsomeraseGenecDNA
fromCamellianitidissima
1,2 1 1
ZHOUXingwen ,LIJiyuan,FANZhengqi
(1.ResearchInstituteofSubtropicalForestry,ChineseAcademyofForestry,Fuyang 311400,Zhejiang,China;
2.YulinNormalUniversity,Yulin 537000,Guangxi,China)
Abstract:AfulllengthcDNAsequenceofchalconeisomerase(CHI)genewasobtainedfrompetalsofCamelliani
tidissimausingthemethodsofReverseTranscriptionPCRandRACE,namedCnCHI(GenBankaccessionNo.
HQ269805.1).SequenceanalysisindicatedthatCnCHIis953bpinfulllengthandcontainsa5′untranslatedre
gion(5′UTR)of56bp,a3′UTRof204bp,andanopeningreadingframe(ORF)of693bpencodinga230pre
dictedaminoacids.SequencealignmentofaminoacidsrevealedthatCnCHIsharedmorethan75%homologywith
CHIfromplantsofRosaceae,Ericaceae,Solanaceaeand99% homologywithC.sinensis.RelativerealtimePCR
analysisindicatedthatCnCHIshowedthetendencyofasharpincreaseattheearlystageandthendecreasedslowly;
thehighesttranscriptabundanceincarpels,andthesecondinstamens,thetranscriptofCnCHIinsepalsandpet
alswerealmostat
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