金花茶查尔酮异构酶基因全长克隆与表达的初步研究 - 林业科学研究.pdf

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金花茶查尔酮异构酶基因全长克隆与表达的初步研究 - 林业科学研究

林业科学研究 2012,25(1):93 99 ForestResearch   文章编号:10011498(2012)01009307 金花茶查尔酮异构酶基因全长克隆与表达的初步研究 1,2 1 1 周兴文 ,李纪元 ,范正琪 (1中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江 富阳 311400;2广西玉林师范学院,广西 玉林 537000) 摘要:利用RT-PCR和RACE技术,从我国珍稀濒危植物金花茶花瓣中获得了查尔酮异构酶(Chalconeisomerase, CHI)基因的cDNA全长,命名为CnCHI,GenBank登录号 HQ2698051。碱基序列分析表明,CnCHI基因全长953 bp,包含56bp的5’非翻译区、204bp的3’非翻译区和一个长为693bp编码230个氨基酸的开放阅读框。氨基酸 序列比对分析表明,CnCHI基因编码蛋白与蔷薇科、杜鹃花科、茄科等植物的CHI蛋白同源性都在75%以上,与山 茶科山茶属茶树CHI蛋白同源性高达99%。相对荧光定量PCR分析表明,CnCHI基因在金花茶花蕾发育过程中 呈现先急剧上升后平缓下降的趋势;在花器官的不同部位中,CnCHI基因表达量最高的是雌蕊,其次是雄蕊,在萼 片和花瓣中的表达量较低且相差不大。 关键词:金花茶;查尔酮异构酶基因;序列分析;相对定量PCR;表达特性 中图分类号:S71846 文献标识码:A CloningandExpressionAnalysisofChalconeIsomeraseGenecDNA fromCamellianitidissima 1,2 1 1 ZHOUXingwen ,LIJiyuan,FANZhengqi (1.ResearchInstituteofSubtropicalForestry,ChineseAcademyofForestry,Fuyang 311400,Zhejiang,China; 2.YulinNormalUniversity,Yulin 537000,Guangxi,China) Abstract:AfulllengthcDNAsequenceofchalconeisomerase(CHI)genewasobtainedfrompetalsofCamelliani tidissimausingthemethodsofReverseTranscriptionPCRandRACE,namedCnCHI(GenBankaccessionNo. HQ269805.1).SequenceanalysisindicatedthatCnCHIis953bpinfulllengthandcontainsa5′untranslatedre gion(5′UTR)of56bp,a3′UTRof204bp,andanopeningreadingframe(ORF)of693bpencodinga230pre dictedaminoacids.SequencealignmentofaminoacidsrevealedthatCnCHIsharedmorethan75%homologywith CHIfromplantsofRosaceae,Ericaceae,Solanaceaeand99% homologywithC.sinensis.RelativerealtimePCR analysisindicatedthatCnCHIshowedthetendencyofasharpincreaseattheearlystageandthendecreasedslowly; thehighesttranscriptabundanceincarpels,andthesecondinstamens,thetranscriptofCnCHIinsepalsandpet alswerealmostat

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