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文学荟萃第四期 ——推送最新的蛋白质组学文献进展 本期向您推送与医学蛋白质组学研究相关的文献 ，发表于不同杂志。下一期我们会继续推送有关其他专题的文 发表献，敬请关注。 本次文献选择来自 MCP, Cancer Res., Diabetes, Sci Signal., Proc Natl Acad Sci U S A, Nat Commun., J Alzheimers Dis., Infect Immun., Molecular Cell 等杂志。  翻译后修饰 1. Acetylome analysis reveals diverse functions of lysine acetylation in Mycobacterium tuberculosis. 关键词：结核分枝杆菌，赖氨酸乙酰化，抗体富集，LC-MS/MS 简介：研究人员采用抗体富集结合液质联用的技术，对结核分枝杆菌 H37Ra 菌株进行赖氨酸乙酰化的大规 模研究，一共鉴定到 137 个蛋白的 226 个乙酰化修饰位点，这些蛋白主要参与糖酵解/糖原异生和氨基酸代 谢等过程；研究首次发现赖氨酸乙酰化与免疫原性调控相关，并为结核分枝杆菌赖氨酸乙酰化的功能研究 提供了重要的数据资源。 2. Adaptive Responses to Dasatinib-Treated Lung Squamous Cell Cancer Cells Harboring DDR2 Mutations . 关键词：鳞状细胞肺癌，DDR2 突变，达沙替尼，耐药，磷酸化蛋白质组学 简介：为了阐明抗肿瘤药物达沙替尼对 DDR2 突变鳞状细胞肺癌细胞的作用，研究人员利用磷酸化蛋白质 组学技术分析了达沙替尼给药后该类细胞的酪氨酸磷酸化系统的变化。在此基础上，作者进一步发现：将 达沙替尼与 MET 和 IGF1R 抑制剂联用可协同干预该类癌细胞的存活，而 EGFR 和 MET 的高度磷酸化则参与 该细胞对达沙替尼的获得性耐药。 3. Diabetes induces lysine acetylation of intermediary metabolism enzymes in the kidney. 关键词：糖尿病肾病，代谢酶，乙酰化修饰，蛋白质组学 简介：为了揭示糖尿病病变敏感组织的蛋白质乙酰化修饰程度的改变，研究人员采用免疫富集联合液质联 用分析的蛋白质组学技术，对链脲佐菌素诱导糖尿病大鼠的肾脏组织进行了蛋白质乙酰化修饰的大规模分 析。借助于生物信息学工具对组学数据的进一步分析，作者发现诸多代谢调控相关酶在该病理条件下具有 明显的乙酰化修饰程度改变，并可能成为治疗靶点。 4. Time-resolved dissection of early phosphoproteome and ensuing proteome changes in response to TGF-β. 关键词：TGF-β ，上皮细胞，Label free ，磷酸化蛋白质组学 简介：为了系统地阐明 TGF-β 的下游信号通路组成及功能，研究人员采用 label free 和磷酸化修饰蛋白质组 学的方法对 TGF-β 刺激不同时间点的人源角质细胞样品进行了分析，并对寻找到的下游相关信号分子的功 能进行了验证和研究，系统地揭示了 TGF-β 对上皮细胞的调控过程和分子机制。 5. Phosphoproteomic analysis identifies the tumor suppressor PDCD4 as a RSK substrate negatively regulated by 14-3-3. 关键词：RSK (p90 ribosomal S6 kinase) ，黑色素瘤，磷酸化蛋白质组学，PDCD4 简介：为了系统地阐明激酶 RSK (p90 ribosomal S6 kinase)在黑色素瘤细胞中的功能，研究人员采用磷酸化蛋 白质组学的方法分析了 RSK 的下游信号通路组成。在此基础上，作者发现 RSK 能够通过将肿瘤抑制因子 PDCD4 磷酸化，促进 PDCD4 与 14-3-3 家族蛋白的结合，进而促使其被降解。该研究表明 RSK 可能在肿瘤发 生过程中具有重要作用。 6. Large-scale analysis of lysine SUMOylation by SUMO remnant immunoaffinity profiling. 关键词：SUMO 化修饰，