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盐芥根响应高盐的microRNA的分离及验证
摘 要
microRNA(miRNA)是真核生物及病毒中存在的由19~25nt组成的一类内
源性非编码的单链小RNA,主要是在转录后水平发挥调控基因表达的功能。植
物miRNA中的调控作用不仅涉及植物的整个生长发育进程(如植物组织器官发
育),而且参与植物对多种逆境胁迫(如营养胁迫、干旱胁迫、高盐胁迫、低温
胁迫等)的响应。
o
近年来盐芥(Theihmgiellahalophila,又称zsalsugmea)作为盐生模式植物,
其抗盐机理备受关注。本研究以高盐处理前后的盐芥根为材料,进行了盐芥根响
应高盐的miRNA分离、鉴定与验证研究,获得的结果如下:
RT-PCR和miRNA基因芯片验证
miRNA、12个下调miRNA。采用了stem.100p
Solexa数据的准确性。
植物miRNA在发挥作用时一般以完全互补或近乎完全互补的方式对靶基因
进行切割,降解靶基冈。冈此利用psRNA软件预测高盐响应miRNA的靶基因,
由于盐芥基因组信息未知,采用EST代替基凶组进行预测,共得到了13个miRNA
其靶基因发挥各种调控功能。
RLM.5’RACE方法得到了新3号miRNA对其靶基因71ll的切割位点,位于结
合位点上游42bp处。证实了miRNA通过在特定位点切割靶基因使其降解,发
挥调控功能。
上述结果为研究miRNA在响应高盐胁迫中的调控作用提供了基础数据,同
时为研究盐芥的耐盐分子机理提供了重要的依据。
RTPCR
关键词:盐芥,rniRNA,Solexa测序,stem.100p
Abstract
is in and formeda
microRNA(miRNA)whichpresenteukaryotesviruses,isby
19—25nt
classof small arole
RNA,and
endogenousnon-codingsingle—stranded plays
inthe of levels.miRNAin not
post_transcriptiDnalregulationgeneexpression plants
the ofthe and of as
regulates
only processgrowthdevelopmentplants(suchplant
tissueand alsoinvolvesina of
stress
organdevelopment),but variety responses(such
asnutrient salt stressetc.)
stress,cold
stress,droughtstress,high
Inrecent asalt
years,Thelhmgiellahalophila(Z modelto
salsuginea),as plant
thesalttolerancemechanism.ismoreandmoreconcemedscientis
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