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盐芥根响应高盐的microRNA的分离及验证

摘 要 microRNA(miRNA)是真核生物及病毒中存在的由19~25nt组成的一类内 源性非编码的单链小RNA,主要是在转录后水平发挥调控基因表达的功能。植 物miRNA中的调控作用不仅涉及植物的整个生长发育进程(如植物组织器官发 育),而且参与植物对多种逆境胁迫(如营养胁迫、干旱胁迫、高盐胁迫、低温 胁迫等)的响应。 o 近年来盐芥(Theihmgiellahalophila,又称zsalsugmea)作为盐生模式植物, 其抗盐机理备受关注。本研究以高盐处理前后的盐芥根为材料,进行了盐芥根响 应高盐的miRNA分离、鉴定与验证研究,获得的结果如下: RT-PCR和miRNA基因芯片验证 miRNA、12个下调miRNA。采用了stem.100p Solexa数据的准确性。 植物miRNA在发挥作用时一般以完全互补或近乎完全互补的方式对靶基因 进行切割,降解靶基冈。冈此利用psRNA软件预测高盐响应miRNA的靶基因, 由于盐芥基因组信息未知,采用EST代替基凶组进行预测,共得到了13个miRNA 其靶基因发挥各种调控功能。 RLM.5’RACE方法得到了新3号miRNA对其靶基因71ll的切割位点,位于结 合位点上游42bp处。证实了miRNA通过在特定位点切割靶基因使其降解,发 挥调控功能。 上述结果为研究miRNA在响应高盐胁迫中的调控作用提供了基础数据,同 时为研究盐芥的耐盐分子机理提供了重要的依据。 RTPCR 关键词:盐芥,rniRNA,Solexa测序,stem.100p Abstract is in and formeda microRNA(miRNA)whichpresenteukaryotesviruses,isby 19—25nt classof small arole RNA,and endogenousnon-codingsingle—stranded plays inthe of levels.miRNAin not post_transcriptiDnalregulationgeneexpression plants the ofthe and of as regulates only processgrowthdevelopmentplants(suchplant tissueand alsoinvolvesina of stress organdevelopment),but variety responses(such asnutrient salt stressetc.) stress,cold stress,droughtstress,high Inrecent asalt years,Thelhmgiellahalophila(Z modelto salsuginea),as plant thesalttolerancemechanism.ismoreandmoreconcemedscientis

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