黄颡鱼β-肌动蛋白基因的克隆及表达分析.pdfVIP

江苏农业学报(Jiangsu ofAgr．Sci．)，2008，24(3)：263～268 263 黄颡鱼 ·肌动蛋白基因的克隆及表达分析 宋 伟 ， 王晓琳 ， 严维辉 ， 刘海琴 ， 李国锋 ， 潘建林 ， 赵庆顺 (1．江苏省农业科学院资源与环境研究所，江苏 南京 210014；2．南京大学模式动物研究所，江苏 南京 210061；3．南京大学 环境科学学院，江苏 南京 210093；4．江苏省淡水水产研究所，江苏 南京 210017) 摘要： 3-肌动蛋白广泛存在于真核生物中，在维持细胞结构、细胞运动和细胞分裂等生理活动中发挥着重要 作用。本文运用PCR技术首次克隆了黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)的B一肌动蛋白基因，其全长为2 124碱基对 (bp)，由5个外显子和4个内含子组成；eDNA长1 128 bp，含有完整的开放阅读框，编码375个氨基酸。黄颡鱼p一 肌动蛋白与其它鱼类氨基酸的同源性(Identity)大于98．6％，核苷酸同源性大于87．3％。系统进化分析表明，黄颡 鱼p一肌动蛋白在进化上高度保守。RT—PCR结果表明，p一肌动蛋白基因在黄颡鱼的脑、鳃、心脏、肠道、肾、肝、红肌、 白肌、卵巢、皮肤、胃、精巢共12种组织中都有表达。 关键词： 黄颡鱼；3-肌动蛋白；基因克隆 中图分类号： s966 文献标识码： A 文章编号： 1000-4440(2008)03-0263-06 Molecular Cloning and Expression Analysis of l3}-actin Gene in Yellow Catfish(Pelteobagrus fulvidraco) S0NG Wei ’_， G Xiao—lin ， YAN Wei一 4 uU Hai—qin ，LI Guo—feng ，PAN Jian-hn4， ZHAO Qing—shun ， (1．Institute ofAgricultural Resources and Environment，Jiangsu Academy ofAgricultural Sciences，Na ng 210014，China；2．Model Animal Research Center，Na ng University，Na ng 210061，China；3．College of Environment，Na ng University，Na ng 210093，China；4．Freshwater Fisheries Research Institute ofJiangsu Pr~ince，Na ng 210017，China) Abstract： B—actin is widely present in eukaryote．It plays important roles in maintaining cytoskeletal structure，cell motility and cell division．In this paper，we report molecular cloning of yellow catfish(Pelteobagrus fulvidraco)B—actin gene by polymerase chain reactions(PCR)．The gene comprises 5 exons and 4 introns．The coding sequence of the cDNA contains 1 1 28 bp and it encodes a protein with 375 amino acids．Sequence analysis indicated that the yellow catfish p—actin exhibits more than 98．6％ amino acid identity and 87．3％ nucleotide identity with other fishes B—actins．Phylogenetic as— say indicated that the yellow cat