黄土高原土壤中细菌群落结构多样性的PCR2DGGE分析.PDF

生态与农村环境学报 　2009 , 25 ( 3) : 39 - 43, 48 　 J ou rna l of E cology and R u ra l E nvironm en t 黄土高原土壤中细菌群落结构多样性的 PCRD GGE分析 1 2 1 1 1 2 1① 潘雪莲 ,黄 　晟 ,方 　昊 ,徐 　军 ,郭晓峰 ,陈　　 ,崔益斌 　( 1. 污染控制与资源化研究国家重点实验室 /南 京大学环境学院 ,江苏 南京 　2 10093; 2. 南京大学地球科学与工程学院 ,江苏 南京 　2 10093) 摘要 : 利用细菌通用引物 ,对从黄土高原 5个地区土壤样品以及西峰剖面 26个土壤样品中提取的总 DNA 进行聚 ( ) ( ) 合酶链式反应 PCR 扩增 ,采用变性梯度凝胶电泳 D GGE 技术对 PCR 产物进行分析 , 以揭示黄土高原土壤中细 菌群落结构的多样性 。针对黄土高原土壤微生物特点进行 D GGE 试验条件优化 ,获得最佳变性梯度为 40% ～ 70% ,最佳电泳时间为 17 h ( 100 V ) 。对不同深度土壤细菌 D GGE 图谱的聚类分析表明 ,不同深度土壤细菌呈现 2 种不同的群落结构 ,推测其成因可能与季风性气候引起的温湿环境变化及冰期有关 。在夏季风加强而冬季风减 弱的时期 ,气候温暖潮湿 ,风化成壤作用强烈 ,在 D GGE 图谱中表现为土壤样品条带多而密 ;反之 ,风化成壤作用 较弱 ,在 D GGE 图谱中表现为条带少而疏 。对洛川 、西峰等 5个地区土壤细菌 ShannonW einer指数的测定结果表 明 , ShannonW einer指数受条带亮度及迁移率的影响 。 关键词 : 黄土高原 ; 微生物多样性 ; 群落结构 ; PCR D GGE 中图分类号 : Q938. 1; X 172　　文献标识码 : A 　　文章编号 : 1673 - 4831 (2009) 03 - 0039 - 05 1 2 1 D iversity of Bacter ia l Comm un ity Structure in So ils of L oess Pla teau. PAN X uelian , HUAN G S heng , FAN G H ao , 1 1 2 1 ( X U J un , GUO X iaof eng , CHEN Yang , CUI Yibin 1. State Key L aboratory of Pollution Control and R esou rce R eu se / Schoo l of the Environm ent,N anj ing U n iversity,N anj ing 2 10093, Ch ina; 2. School of Earth Science s and Engineering,N an j ing U n iversity,N anj ing 2 10093, Ch ina) A b stract: So il samp le s were co llected from five region s and 26 soil samp les from the X ifeng Profile of