利用TCGA和GEO数据集分析c_省略_in11在胃癌中的表达和临床意义_王硕.pdfVIP

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2017-07-29 发布于北京
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利用TCGA和GEO数据集分析c_省略_in11在胃癌中的表达和临床意义_王硕.pdf

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vol.25 No.6 武警后勤学院学报（医学版）第25卷第6期 424 Jun. 2016 JournalofLogisticsUniversityofPAP （MedicalSciences） 2016年6月丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐论著丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐丐利用利用TCGATCGA及及GEOGEO数据集分析数据集分析claudinclaudin1111在胃癌中的表达及在胃癌中的表达及临床意义临床意义王硕，李智，郑春雷，曲秀娟，刘静，曲晶磊，车晓芳，刘云鹏（中国医科大学附属第一医院肿瘤内科，辽宁沈阳 110001）摘要：【目的】研究claudin11在胃癌中的表达及临床价值，预测claudin11参与肿瘤发生发展的机制。【方法】从癌症基因组图谱（thecancergenomeatlas，TCGA）和人类肿瘤相关的基因表达汇编（geneexpressionomnibu，GEO）数据库收集胃癌数据集，下载claudin11基因表达谱及临床信息。分析claudin11表达和临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析 P＝（genesetenrichmentanalysis，GSEA）方法预测claudin11的调控基因。【结果】在TCGA数据集中claudin11表达水平与年龄（ 0.031）、T分期（ P＝0.007）、有无淋巴结转移（P＝0.039）、TNM分期（P＝0.03）及分化程度（P0.001）相关。Claudin11高表达患者总生存期明显短于低表达患者（ P0.001）。Claudin11高表达样本富集了细胞黏附、紧密连接、细胞外基质、骨架蛋白调控等相关等基因集。【结论】Claudin11在胃癌中是一种不良预后因素，可以作为判断预后的标志物。关键词：胃癌；癌症基因组图谱；人类肿瘤相关的基因表达汇编；claudin11；预后【文章编号】2095-3720（2016）06-0424-04 【中图分类号】R735.2 【文献标志码】A DOI:10.16548/j.2095-3720.2016.06.002 Analysisofclaudin11 expressioningastriccanceranditsclinicalsignificanceviaTCGA andGEOdatasets WANGShuo,LIZhi,ZHENGChun-lei,QUXiu-juan,LIUJing,QUJing-lei,CHEXiao-fang,LIUYun-peng(D