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质粒DNA提取和浓度纯度测定
质粒DNA提取及浓度纯度测定
质粒(Plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子,大小在1—200Kb之间,是具有双链闭合环状结构的DNA分子,主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中。质粒具有复制和控制机构,能够在细胞质中独立自主地进行自身复制,并使子代细胞保持它们恒定的拷贝数。从细胞生存来看,没有质粒存在基本上不防碍细胞的存活,因此质粒是寄主性的自主复制因子。根据质粒的这种特性,通常采用DNA体外重组技术和微生物转化等基因工程的技术和方法,使重组到质粒的某种基因带进受体细胞表达它的遗传性质,改变或修饰寄主细胞原有的代谢产物,或产生新的物质。目前,质粒已广泛地用作基因工程中DNA分子无性繁殖的运载体,同时它也是研究DNA结构与功能的较好模型。
所有分离质粒DNA的方法都包括三个基本步骤:培养细菌使质粒扩增;收集和裂解细胞;分离和纯化质粒DNA。碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。在pH值介于12.0—12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,由于共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质— HYPERLINK /yp/product-list-703.html \t _blank SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
实验中,在 HYPERLINK /yp/product-list-700.html \t _blank EDTA存在下,用溶菌酶破坏细菌细胞壁,同时经过NaOH和阴离子去污剂 HYPERLINK /yp/product-list-703.html \t _blank SDS处理使细胞膜崩解,从而达到菌体充分的裂解,同时细菌染色体DNA缠绕附着在细胞膜碎片上,离心时易被沉淀出来,而质粒DNA则留在上清液内,其中还含有可溶性蛋白、核糖 HYPERLINK /yp/product-list-430.html \t _blank 核蛋白和少量染色体DNA,实验中加入蛋白质水解酶和 HYPERLINK /yp/product-list-471.html \t _blank 核酸酶可以使它们分解,通过碱性酚(pH8.0)和氯仿—异戊醇混合液的抽提可以去除蛋白质等。异戊醇的作用是降低表面张力,可以减少抽提过程产生的泡沫,并使离心后水层、变性蛋白质层和有机层维持稳定。含有质粒DNA的上清液可用乙醇或异戊醇沉淀,获得质粒DNA。
[仪器、材料与试剂]
(一) 仪器和材料
恒温培养箱、恒温 HYPERLINK /yp/product-list-339.html \t _blank 摇床、台式 HYPERLINK /yp/product-list-47.html \t _blank 离心机、高压灭菌锅、紫外可见 HYPERLINK /yp/product-list-230.html \t _blank 分光光度计、移液枪、Eppendorf管、E.coli DH5α(pSC123)菌株
(二) 试剂
质粒DNA提取试剂:
溶液I:50mM 葡萄糖 25mM HYPERLINK /yp/product-list-702.html \t _blank Tris·Cl (pH8.0) 10mM HYPERLINK /yp/product-list-700.html \t _blank EDTA (pH8.0)
溶液Ⅱ:0.2M NaOH 1% HYPERLINK /yp/product-list-703.html \t _blank SDS 用前等体积混合
溶液Ⅲ:5M乙酸钾60mL 冰乙酸11.5mL 水28.5mL
TE缓冲液:10mM HYPERLINK /yp/product-list-702.html \t _blank Tris·Cl (pH8.0) 1 mM HYPERLINK /yp/product-list-700.html \t _blank EDTA(pH8.0)
乙醇 70%乙醇(放—20℃冰箱中,用后即放回) LB液体培养基
[实验步骤]
(一) 提取质粒
1、接种一个单菌落于5mL含相应 HYPERLINK /yp/product-list-671.html \t _blank 抗生素的LB液体培养基中,37℃振荡培养至饱和状态(OD600=4)或过夜。
2、取1.5mL培养物倒入微量 HYPERLINK /yp
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