不同组织嗜性传染性支气管炎病毒核衣壳基因的遗传变异性分析.pdfVIP

第 19 卷 　第 1 期 病　　毒　　学　　报 Vol. 19 　　No. 1 　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　 2 0 0 3 年 3 月 CHINESE JOURNAL OF VIROLO GY March 　2 0 0 3 不同组织嗜性传染性支气管炎病毒核衣壳基因的遗传变异性分析 1 1 ,2 1 1 1 周继勇 ,张德勇 ,丁红梅 ,程丽琴 ,陈吉刚 ( 1 浙江大学 　动物预防医学研究所 ;2 浙江大学 　生命科学学院 　杭州 　310029) ( ) ( 摘要 :根据 GenBank 发表的传染性支气管炎病毒 infectious bronchitis virus , IBV Beaudette 毒株核衣壳 nucleocap sid ,N) 基因序列设计一对特异性引物 ,利用 RT - PCR 方法分别扩增了疫苗毒株 IBV - H52 、嗜腺胃 ZJ971 株、嗜肾 IBV - X 和 N 株的 N 基因 ORF ,并克隆到质粒载体 pBluescript SK ( + ) ,测序后用 PCgene 和 DNA Star 软件分析。 结果显示 :4 株 IBV 的N 基因均含有一个长 1 230bp 的 ORF ,编码一由 409 个氨基酸残基组成的 N 蛋白。嗜肾 IBV - X 和 N 毒株的 N 基因存在 Hi nd Ⅲ酶切位点。与来自 GenBank 的另外 8 株 IBV 比较 ,ZJ971 株与它们的 N 蛋白的核苷酸及氨基酸序列同源性分别在 882 %～986 %和 912 %～978 % ;N 株则分别为 866 %～874 %和 905 %～915 % ; X 株分别为 863 % ～874 % 和 900 % ～915 % ; H52 分别为 904 % ～983 % 和 920 % ～ 980 % 。ZJ971 株、N 和 X 株的 N 基因的突变特点是散在的点突变。嗜腺胃 ZJ971 株核衣壳蛋白的氨基酸序列的 最显著的遗传变异特征是 H111D 、S117A 、V142L 、P171A 和 E401 D ; 嗜肾 IBV - X 和 N 株核衣壳蛋白的氨基酸序列的最 46 48 189 190 220 223 236 237 240 286 299 301 334 335 显著的遗传变异特征是 A S 、A P 、L R 、N S 、E D 、I A 、V Y 、S K 、K Q 、Q R 、T K 、R E 、E D 、V E 、V336 P 和 T351 S 。 关键词 :传染性支气管炎病毒 ;核衣壳蛋白基因 ;克隆 ;变异 ( ) 中图分类号:S8526596 　　文献标识码 :A 　　文章编号 :1000 - 8721 2003 01 - 0059 - 05 (