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浒苔中C3及C4途径关键酶的研究
摘 要
浒苔中C 和C 途径关键酶的研究
3 4
摘 要
2008 年 6 月,黄海海域出现大规模浒苔绿藻,大量浒苔堆积在青岛沿海一
线,对青岛近海的旅游景观和海水养殖业造成了巨大破坏。浒苔绿潮的出现正值
青岛奥帆赛准备期间,绿潮的成因及其潜在的危害效应得到了国内外的普遍关
注。但是,到现在为止,对于浒苔绿潮暴发的原因还没有定论。浒苔能够在短时
间内大规模暴发,说明其有非常有效的光合系统,特别是光合碳同化途径。
光合作用将无机物转化为有机物,同时固定太阳的光能,是地球上最重要的
化学反应。C3 植物中 C4 途径的发现,以及某些 C4 植物的特定发育阶段进行 C3
碳同化方式,说明植物的光合碳同化途径具有极大的可塑性。随着新一代测序技
术的发展,在一些藻类中发现了与 C4 途径相关的基因。在全基因组测序的单细
胞绿藻Ostreococcus tauri 中发现了C 途径中所有的相关基因。通过对海洋硅藻
4
威氏海链藻(Thalassiosira weissflogii )和三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum )
的基因组测序,也发现了与C4 光合作用相关的基因。在CO2 浓度降低时,威氏
海链藻(T. weissflogii)的PEPC 的活性会增加。
通过叶绿素荧光仪Dual-PAM-100 测定浒苔在不同条件(干出不同时间、不
同盐度、不同光照强度和不同温度)下PSII 的最大光化学效率(Fv/Fm )和实际
光化学效率Y (Ⅱ)。在干出、高盐60‰、低盐0‰、强光2000μmol m-2 s-1、高
温35℃等条件下,浒苔的Fv/Fm 和Y (Ⅱ)逐渐降低,表明这些条件可以引起
浒苔的胁迫响应。特别是在干出和强光条件下,浒苔的 Fv/Fm 和 Y (Ⅱ)降低
幅度很大,说明这两个条件可以引起浒苔强烈的胁迫响应。
我们采用454 测序技术,对浒苔(Ulva prolifera )的转录组进行测序。得到
了445,787 个高质量的read ,占原始序列的88.5% 。通过组装,得到了13,426 个
contig,平均长度为1,000 bp。Contigs 通过进一步组装,得到10,784 个 isotig 。
组装成的Isotigs 的平均长度为1,515 bp。我们将得到的序列与KEGG 数据库进
行比较,发现浒苔的固碳途径中含有C 途径和C 途径所需要的几乎所有酶类。
3 4
根据浒苔转录组测序获得的PPDK 基因的部分序列,设计引物,通过PCR 扩增
I
浒苔中C 和C 途径关键酶的研究
3 4
得到PPDK 基因的部分序列。然后根据PPDK 基因的部分序列进行5’-RACE 和
3’-RACE 反应,最终得到了PPDK 基因cDNA 全长序列。该序列全长为3114 bp,
开放阅读框(ORF )长度为2700 bp ,编码899 个氨基酸残基,等电点为5.60,
相对分子质量为96.43 KDa,在NCBI 上的登录号为JN936854 。根据浒苔的PPDK
氨基酸序列建立的系统进化树可以看出,在高等植物和藻类中同时存在C 、C -C
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和C 物种,说明C 途径的出现是一种多源独立进化。
4 4
通过实时荧光定量 PCR 法对浒苔中 C3 途径和 C4 途径关键酶基因 rbcL 和
PPDK 的研究发现,在浒苔受到
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