16S 测序结题报告.PDF

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2017-08-14 发布于境外
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16S 测序结题报告项目名称: XXXXXX 客户单位: XXXXXX 报告单位: XXXXXX 报告日期: XXXXXX 16S 目录一、项目信息 1 二、项目流程 2 2.1 项目执行流程 2 2.1.1 DNA 提取及检测 2 2.1.2 PCR 扩增 2 2.1.3 Miseq/Miniseq 文库构建 2 2.1.4 Miseq/Miniseq 测序 3 2.2 生物信息分析流程 4 2.3 项目分析内容 5 三、项目结果报告 6 3.1 测序数据预处理 6 3.1.1 测序数据过滤与拼接 6 3.2 OTU 分析 7 3.2.1 OTU 聚类分析 7 3.2.2 OTU 谱 8 3.2.3 OTU 注释分析 9 3.2.4 Core microbiome 分析 10 3.2.5 OTU Venn 图分析11 3.2.6 OTU PCA 分析 12 3.2.7 物种丰度分析 13 3.2.8 系统发育分析 14 16S 3.3 α-多样性 15 3.3.1 α-多样性指数 15 3.3.2 稀释曲线（Rarefaction Curve ） 17 3.4 β-多样性 18 3.4.1 UniFrac 热图分析 18 3.4.2 PCoA 分析 20 3.4.3 聚类分析 21 3.5 组间差异显著性分析 22 3.5.1 Test 22 3.5.2 LEfSe 分析 24 3.5.3 Anosim 分析 25 3.5.4 Random forest 分析 26 3.6 环境因子关联分析 28