ADF教程:如何计算基态CDD-分子电子密度与各片段电子密度之差.pdfVIP

ADF教程:如何计算基态CDD-分子电子密度与各片段电子密度之差.pdf

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ADF教程:如何计算基态CDD-分子电子密度与各片段电子密度之差

费米科技 (北京)有限公司 刘俊 计算基态CDD:分子电子密度与各片段电子 密度之差 本例以BH -NH 为例: 3 3 第一步,优化基态的分子结构(详情请点击); 第二步,导入优化好的分子结构,划分片段,进行计算,如下图所示: 按住Shift 键,鼠标画框,选中NH ,然后选择右侧窗口的Model — Region,点击加号,如 3 下图 则成功将NH3 设定为 Region_1;可以用同样的方式,将BH3 设定为 Region_2,如下图所示 (切记避免个别原子既被归入一个区,又被归入另一个区) 启动片段功能: 费米科技 (北京)有限公司 刘俊 主面板参数设置如下图所示(基组、泛函选择参考“优化基态的分子结构(详情请点击)”) 保存任务,并运行。 第三步,结果查看: 在ADFinput 窗口点击SCM-View ,弹出View 窗口。点击Field — Calculated,下方选择 费米科技 (北京)有限公司 刘俊 注意上图左下角的C-1,这是“分子电荷密度-片段结合为分子之前的电子密度之和=基态差分 电荷密度”的标号。后面会用到这个标号。 Add — Isosurface: Double(+/-),之后选择C-1 如下图所示: 费米科技 (北京)有限公司 刘俊 之后,即显示基态的差分电荷密度:分子电子密度与各片段电子密度之差。调整等值面的值, 如图中所示,此例调整为0.01 显示的比较清楚,分别更改为其他数值,例如0.03 等等,这 样能够了解在空间的分布情况。 费米科技 (北京)有限公司 刘俊

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