氨基酸2013.ppt

甘、丙、缬、亮、异亮 丝、苏、半胱、蛋、 天冬、谷、赖、精 苯丙、酪、色、组、脯 R groups have –COOH. Amino Acids with Acidic Side Chains R groups are negatively charged at physiological pH (=7.4). AAs are soluble in H2O. Folin-酚试剂法测定蛋白质含量 Folin酚试剂法测定蛋白质含量是最灵敏的方法之一。此法的显色原理与双缩脲方法是相同的(甲试剂由碳酸钠、氢氧化钠、硫酸铜及酒石酸钾钠组成)，只是加入了第二种试剂，即Folin—酚试剂(磷钼酸和磷钨酸、硫酸、溴等组成)，以增加显色量，从而提高了检测蛋白质的灵敏度。这两种显色反应产生深蓝色的原因是：在碱性条件下，蛋白质中的肽键与铜结合生成复合物。 Folin—酚试剂中的磷钼酸盐—磷钨酸盐被蛋白质中的酪氨酸和苯丙氨酸残基还原，产生深蓝色（钼兰和钨兰的混合物）。在一定的条件下，蓝色深度与蛋白的量成正比。 2012北京大学生物化学试题 思考题： 一个寡肽，研究人员无论如何也不能进行Edman降解法测序，分析两种可能性原因？ To make trypsin even more versatile you can modify side chains of amino acids 肽键的结构特点： C-N： 0.149 nm 肽键： 0.132nm C=N ：0.127 nm （1）酰胺氮上的孤对电子与相邻羰基之间形成共振杂化体。 （2）肽键具有部分双键性质，不能自由旋转。肽键比一般 C-N键短 （3）肽键具有平面性，组成肽键的4个原子和2个 Cα几乎处在同一平面内（酰氨平面）。 （4）肽键亚氨基在pH014内不解离。 （5）肽链中的肽键一般是反式构型， 而Pro的肽键可能出现顺、 反两种构型． 肽键的结构特点 肽键的紫外吸收 210～230nm 蛋白质溶液在238nm处的光吸收的强弱,与肽键的多少成正比。 相关名词-肽单元 肽单元：参与肽键的6个原子被约束于一个平面上，与此相应的-Cα-CO-NH-Cα-则称为肽单元 。 一个氨基酸 相关名词-多肽主链 多肽主链：在多肽链中由肽键连接的各氨基酸残基形成的长链骨架为多肽链的主链。或：肽链的骨干是由肽单元重复排列而成长链，称为主链。 长链骨架 N-C-C-N-C-C-N-C-C 判断题：蛋白质中主链骨架由NCCNCCNCC……和NCCCNCCCNCC……等方式组成 2003年福州大学生物化学 1、肽的晶体是离子晶格，溶点高。 2、旋光性：一般短肽的旋光度等于其各个氨基酸的旋 光度的总和，长肽不等于。 3、具有两性解离和等电点：肽的酸碱性质－－决定于 末端α-氨基和α-羧基及R基。在长肽或蛋白质中，可解离的基团主要是侧链基团。 肽中C端的羧基的pK要比自由氨基酸的pK大. 肽中N端的氨基的pK要比自由氨基酸的pK小，酸性强了 R基的解离和氨基酸差不多。 （二）、肽的物理和化学性质 氨基酸和肽解离比较 自由氨基酸的pK要比肽中C端的羧基的pK小. 自由氨基酸的pK要比肽中N端的氨基的pK大， -e + + + - 肽的两性解离和肽的等电点 Comparing the pKa Values of Alanine and Polyalanine Amino acid or peptide pK1-cooH pK2-NH3+ Ala 2.34 9.69 Ala–Ala 3.12 8.30 Ala–Ala–Ala 3.39 8.03 Ala–(Ala)n–Ala, n大于4 3.42 7.94 The titration of di-, tri-, and larger oligopeptides of alanine also shows the ionization of only two functional groups, although the experimental pKa values aredifferent. The trend in pKa values is summarized in the table. 肽的物理和化学性质 双缩脲