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附件1DBS13
附件1 DBS13前 言
本标准系首次发布。
本标准的附录A为规范性附录。
本标准由河北省卫生与计划生育委员会提出并归口。
食品安全地方标准
食品中诺如病毒检测
1 范围
RT-PCR和实时荧光RT-PCR检测方法。
本标准适用于贝类、生食叶类蔬菜和包装饮用水等食品中GⅠ型和GⅡ型诺如病毒的检测。
2 术语和定义
诺如病毒 norovirus
诺如病毒属于人类杯状病毒科,诺如病毒属,是一组形态相似、抗原性略有不同的病毒颗粒。诺如病毒直径约为26nm~35nm,无包膜,表面粗糙,球形,呈二十面体对称。诺如病毒基因组是单股正链RNA,组成长约7kb~7.5kb, 电镜下缺乏显著的形态学特征,负染色电镜照片显示,诺如病毒是具有典型的羽状边缘、表面有凹痕的小圆状结构病毒。诺如病毒共可分为G Ⅰ-G Ⅴ5个基因型, 其中感染人的主要是GⅠ型和GⅡ型。
设备和材料
3.2 组织匀浆器或其他可以破碎样品的工具。
3.3 普通冰箱,超低温冰箱(-80℃±5℃)。
3.4 高速冷冻离心机(最大离心力大于15000g)。
3.5 恒温水浴箱37℃~65℃。
3.6 PCR扩增仪。
实时荧光PCR仪。
电泳仪。
凝胶成像系统。
3.10 震荡混匀器。
pH计。
水过滤系统。
微量可调移液器:1 μL~10 μL,10 μL~100 μL,100 μL~1000 μL。
洗耳球或电动移液器。
无RNA酶的玻璃容器、微量加样器吸头、无菌50mL离心管、无菌1.5mL离心管和PCR管。
无RNA酶的一次性移液管10mL、25mL。
混合硝酸纤维素膜,孔径0.22μm。
4 试剂
除有特殊说明外,所有实验用试剂均为分析纯。
4.1 无RNA酶的超纯水:见附录A.1。
4.2 甘氨酸缓冲液:见附录A.2。
4.3 PEG 8000沉降液:见附录A.3。
4.4 MgCl2溶液:见附录A.4。
4.5 牛肉膏-甘氨酸洗脱液: 见附录A.5。
4.6 氯仿。
4.7 1 mol/L盐酸。
4.8 1 mol/L NaOH。
4.9 病毒RNA提取试剂盒。
4.10 Taq DNA聚合酶:-20℃保存,避免反复冻融。
4.11 逆转录酶:-20℃保存,避免反复冻融。
4.12 RNA酶抑制剂:-20℃保存,避免反复冻融。
4.13 dNTPs:含dCTP、dGTP、dATP、dTTP各10mmol/L。
4.14 引物和探针:使用浓度为25 μmol/L,-20℃保存,引物和探针序列见表1和表2。
表1 普通RT-PCR检测引物
检测的病毒类群 引物序列 片段大小/bp GI和GII 正向引物F:5’-ATACCACTATGATGCAGATTA-3’ 326 反向引物R: 5’-TCATCATCACCATAGAAAGAG-3’
检测的病毒类群 引物和探针序列 片段大小/bp GI 正向引物F: 5’-CGC TGG ATG CGN TTC CAT-3’
反向引物R: 5’-CCT TAG ACG CCA TCA TCA TTT AC-3’
探针: 5’-FAM-TGG ACA GGA GAY CGC RAT CT-TAMRA-3’ 86 GII
正向引物F: 5’-ATG TTC AGR TGG ATG AGR TTC TCW GA-3’
反向引物R: 5’-TCG ACG CCA TCT TCA TTC ACA-3’
探针: 5’-FAM-AGC ACG TGG GAG GGC GAT CG-TAMRA-3’ 89
4.15 1×TAE:见附录A.6。
4.16 分子量标记:100 bp~1000 bp。
4.17 诺如病毒阳性对照。
4.18 诺如病毒阴性对照。
4.19 溴化乙锭(EB)溶液(10 μg/μL):见附录A.7。
4.20 10×上样缓冲液:见附录A.8。
4.21 含0.5μg/mL溴化乙锭(或 5% GoldView)的 1.5%琼脂糖凝胶:见附录A.9 。
5 检测程序
图1 诺如病毒检测程序
6 检测步骤
6.1 样品的运输与保存
6.2 样品处理和病毒富集
6.2.1 贝类
6.2.1.1 取样:首先用灭菌蒸馏水将贝壳表面的污泥清洗干净,打开贝壳后,倒掉腔内的液体,使用无菌的剪刀和镊子取贝类消化腺组织。
6.2.1.2 无菌取5g消化腺组织,在组织匀浆器中高速匀浆3 min或切碎成2 mm3以下的小块,放入50 mL离心管中,加入35mL甘氨酸缓冲液(样品重量与缓冲液体积之比为
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