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中国荷斯坦牛红毛基因变异及其编码蛋白结构预测李秋玲李建斌张争锋王洪梅高运东侯明海仲跻峰山东省农业科学院奶牛研究中心济南山东省计算中心济南摘要目的通过对中国荷斯坦牛基因的核苷酸序列分析和蛋白结构预测探讨中国荷斯坦牛红白花毛色形成的分子机制方法采用技术对基因进行分型利用生物信息学方法对其蛋白结构特征进行模拟分析结果检测出与毛色表型相关的三种基因型基因型在中国荷斯坦黑白花牛中占优势基因型在中国荷斯坦红白花牛中占优势蛋白预测结果显示基因型个体的缺失突变使蛋白质翻译提前终止引发二级结构改变导致中国荷斯坦牛
中国荷斯坦牛红毛基因变异及其编码蛋白结构预测
李秋玲1,李建斌1,张争锋2,王洪梅1,高运东1,侯明海1,仲跻峰1
(1山东省农业科学院奶牛研究中心,济南 250100;2山东省计算中心,济南 250014)
摘要:【目的】通过对中国荷斯坦牛MC1R基因的核苷酸序列分析和蛋白结构预测,探讨中国荷斯坦牛红白花毛色形成的分子机制。【方法】采用PCR-RFLP技术对MC1R基因进行分型,利用生物信息学方法对其蛋白结构特征进行模拟分析。【结果】检测出与毛色表型相关的三种基因型,EE基因型在中国荷斯坦黑白花牛中占优势,ee基因型在中国荷斯坦红白花牛中占优势。蛋白预测结果显示,ee基因型个体的缺失突变使蛋
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