Wien2k09MPI编译方法.docVIP

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Wien2k09MPI编译方法

Wien2k 09 MPI 编译方法 INTEL编译器,安装INTEL编译器和MKL库 使用root帐号,解压相应的文件,进入解压目录,运行 ./install.sh,安装intel c和fortran编译器,本文使用的是11.1.073的编译器; 其次intel mkl库,这里用的是38的版本; 安装所有的文件后,把相关的sh和csh文件复制到 /etc/profile.d/ 文件夹内,然后退出root帐号,用普通帐号,输入source /etc/profile,之后可以判断icc和ifort是否已经能正常使用。 安装mpich 因为wien2k采用intel编译器,这里采用intel编译器来编译mpich,这里使用的是2-1.2.1的版本,使用root帐号,解压文件后,进入解压文件夹,输入 ./configure --prefix=/opt/mpich CC=icc CFLAGS=”-O3 -xS” CXX=icpc CXXFLAGS=”-O3 -xS” F77=ifort F90=ifort FFLAGS=”-O3 -xS” F90FLAGS=”-O3 -xS” make make install 设置环境变量: nano ~/.bashrc #--- for mpich MPI=/opt/mpich export MPI PATH=$PATH:$MPI/bin export PATH MPI_LIB=$MPI/lib MPI_INCLUDE=$MPI/include export MPI_LIB export MPI_INCLUDE 重新登陆用户或者source ~/.bashrc后再编译下面的. 安装fftw fftw有2个版本:一个是2.X.X一个是3.X.X 对于 3.X.X,mpi接口还没有提供。所以采用2.X.X tar xzvf fftw-2.1.5.tar.gz ./confiure --prefix=/opt/fftw --enable-mpi CC=icc CFLAGS=”-O3 -xS” F77=ifort FFLAGS=”-O3 -xS” make make install 安装wien2k tar xvf WIEN2k_09.tar gunzip *.gz ./expand_lapw ./siteconfig_lapw S specify a system 选择系统 输入K [代表 Linux (Intel ifort 10.1 compiler + mkl 10.0 )] 输入S 保存 C specify compiler 选择编译器 输入ifort 输入icc O specify compiler options, BLAS and LAPACK 选择编译器参数 输入O 输入 -FR -mp1 -w -prec_div -pc80 -pad -align -O3 -xS 输入L 输入 -L/opt/intel/mkl/38/lib/em64t 输入R 输入 -lmkl_lapack -lmkl_intel_lp64 -lmkl_core -lmkl_sequential -lguide -lpthread 输入S [保存] P configure Parallel execution 选择并行编译参数 Shared Memory Architecture? (y/n) 选择n Do you have MPI and Scalapack installed and intend to run finegrained parallel? (This is usefull only for BIG cases)! (y/n) 输入y Your compiler: 输入mpif90 输入RP 输入-lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 -L/opt/fftw/lib -lfftw_mpi –lfftw $(R_LIB) 输入MP 输入mpirun -np _NP_ -machinefile _HOSTS_ _EXEC_ 输入 S [保存] D Dimension Parameters 输入 D 输入 1 输入 NMATMAX 输入 数值 [ 大小根据内存来确定] 输入 NUME 输入 数值 [ 大小根据内存来确定] 例子: NMATMAX=sqrt(内存转化为字节数/10) NUME=NMATMAX/10 假如内存为4G,即4000 000 000字节。Sqrt(4000 000 000/10)=20000 NMATMAX=20000 NUME=20000/10=2000 输入 Q [完成数值设置] R Compile/Recompile 选

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