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Wien2k09MPI编译方法
Wien2k 09 MPI 编译方法
INTEL编译器,安装INTEL编译器和MKL库
使用root帐号,解压相应的文件,进入解压目录,运行 ./install.sh,安装intel c和fortran编译器,本文使用的是11.1.073的编译器;
其次intel mkl库,这里用的是38的版本;
安装所有的文件后,把相关的sh和csh文件复制到 /etc/profile.d/ 文件夹内,然后退出root帐号,用普通帐号,输入source /etc/profile,之后可以判断icc和ifort是否已经能正常使用。
安装mpich
因为wien2k采用intel编译器,这里采用intel编译器来编译mpich,这里使用的是2-1.2.1的版本,使用root帐号,解压文件后,进入解压文件夹,输入
./configure --prefix=/opt/mpich CC=icc CFLAGS=”-O3 -xS” CXX=icpc CXXFLAGS=”-O3 -xS” F77=ifort F90=ifort FFLAGS=”-O3 -xS” F90FLAGS=”-O3 -xS”
make
make install
设置环境变量:
nano ~/.bashrc
#--- for mpich
MPI=/opt/mpich
export MPI
PATH=$PATH:$MPI/bin
export PATH
MPI_LIB=$MPI/lib
MPI_INCLUDE=$MPI/include
export MPI_LIB
export MPI_INCLUDE
重新登陆用户或者source ~/.bashrc后再编译下面的.
安装fftw
fftw有2个版本:一个是2.X.X一个是3.X.X
对于 3.X.X,mpi接口还没有提供。所以采用2.X.X
tar xzvf fftw-2.1.5.tar.gz
./confiure --prefix=/opt/fftw --enable-mpi CC=icc CFLAGS=”-O3 -xS” F77=ifort FFLAGS=”-O3 -xS”
make
make install
安装wien2k
tar xvf WIEN2k_09.tar
gunzip *.gz
./expand_lapw
./siteconfig_lapw
S specify a system 选择系统
输入K [代表 Linux (Intel ifort 10.1 compiler + mkl 10.0 )]
输入S 保存
C specify compiler 选择编译器
输入ifort
输入icc
O specify compiler options, BLAS and LAPACK 选择编译器参数
输入O
输入 -FR -mp1 -w -prec_div -pc80 -pad -align -O3 -xS
输入L
输入 -L/opt/intel/mkl/38/lib/em64t
输入R
输入 -lmkl_lapack -lmkl_intel_lp64 -lmkl_core -lmkl_sequential -lguide -lpthread
输入S [保存]
P configure Parallel execution 选择并行编译参数
Shared Memory Architecture? (y/n)
选择n
Do you have MPI and Scalapack installed and intend to run
finegrained parallel? (This is usefull only for BIG cases)!
(y/n)
输入y
Your compiler:
输入mpif90
输入RP
输入-lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 -L/opt/fftw/lib -lfftw_mpi –lfftw $(R_LIB)
输入MP
输入mpirun -np _NP_ -machinefile _HOSTS_ _EXEC_
输入 S [保存]
D Dimension Parameters
输入 D
输入 1
输入 NMATMAX
输入 数值 [ 大小根据内存来确定]
输入 NUME
输入 数值 [ 大小根据内存来确定]
例子:
NMATMAX=sqrt(内存转化为字节数/10)
NUME=NMATMAX/10
假如内存为4G,即4000 000 000字节。Sqrt(4000 000 000/10)=20000
NMATMAX=20000
NUME=20000/10=2000
输入 Q [完成数值设置]
R Compile/Recompile
选
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