单晶结构分析手写完美版.docVIP

晶体结构解析 Shelxtl 使用流程 ※ 解析原始文件有hkl文件（或raw文件），包含衍射数据；p4p文件，包含晶胞参数 ※ 为一个晶体的数据建立project，该项目下所有文件具有相同的文件名；一旦在XPREP中发生hkl文件的矩阵转换，则需要输出新文件名的hkl等文件，因此要建立新的project。 ※ 首先运行XPREP，寻找晶体的空间群 ※ 然后运行XS，根据XPREP设定的空间群，寻找结构初解 ※ 在Xshell中观察初解是否合理，如不合理，需重回XPREP中设定其他的空间群 Xshell 使用流程 ※ 找出重原子或者确定性大的原子 ※ 找出其余非氢原子 ※ 精修原子坐标 ※ 精修各项异性参数 ※ 找到氢原子(理论加氢或差值傅里叶图加氢) ※ 反复精修，直到wR2等指标收敛。最后的R10.06(0.08) wR20.16(0.18) ※ 通过HTAB指令寻找氢键，判定氢的位置是否合理，并且将相关氢键信息通过HTAB和EQIV指令写进ins文件中 ※ 将原子排序(sort) cif 文件生成和检测错误流程 ※ 在步骤1、2完成后，在ins文件中加入以下三条命令 bond $H conf acta 此时生成了cif和fcf文件，将cif文件拷贝到planton所在文件夹中检测错误，也可以通过如下在线检测网址： HYPERLINK /services/cif/checkcif.html \t _parent /services/cif/checkcif.html 根据错误提示信息，修改或重新精修，将A、B类错误务必全部消灭，C类错误尽量消灭。 Acta E 投稿准备流程 投稿前，请务必切实做好如下工作： ※ 按步骤1、2、3解析晶体并生成相应cif和fcf文件。 ※ 准备结构式图(Chemical structural diagram)、分子椭球图(Molecular ellipsoid diagram)和晶胞堆积图(Packing diagram)，最好是pdf格式。 按要求撰写文章的文字部分，填写cif中相应段落，注意格式要求！ _publ_section_title 题目 _publ_section_abstract 摘要 _publ_section_related_literature 相关文献 _publ_section_comment 评论 _publ_section_exptl_prep 制备方法 _publ_section_exptl_refinement 精修说明 _publ_section_references 参考文献 _publ_section_figure_captions 插图说明 _publ_section_table_legends 表格说明 _publ_section_acknowledgements 致谢 ※ 将cif中需要填写的其他部分（在cif的标准空白样本中以！标注）全部完成，并再次检查整个cif文件格式和内容。 参考书目 HYPERLINK 1/opac/openlink.php?title=%B5%A5%BE%A7%BD%E1%B9%B9%B7%D6%CE%F6%D4%AD%C0%ED%D3%EB%CA%B5%BC%F9单晶结构分析原理与实践 O723/0301 陈小明，蔡继文, 科学出版社 2003 2007年第2版 O723/10001 HYPERLINK 1/opac/openlink.php?title=%B9%CC%CC%E5%BF%C6%D1%A7%D6%D0%B5%C4%BF%D5%BC%E4%C8%BA固体科学中的空间群 O711/8401 (美)(G.Burns),(A.M.Galzer) 高等教育出版社 1981 HYPERLIN