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氨基酸密码子表
丙氨酸
Alanine
A 或 Ala
89.079
CH 3 -
脂肪族类
精氨酸
Arginine
R 或 Arg
174.188
HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 -
碱性氨基酸类
天冬酰胺
Asparagine
N 或 Asn
132.104
H 2 N-CO-CH 2 -
酰胺类
天冬氨酸
Aspartic acid
D 或 Asp
133.089
HOOC-CH 2 -
酸性氨基酸类
半胱氨酸
Cysteine
C 或 Cys
121.145
HS-CH 2 -
含硫类
谷氨酰胺
Glutamine
Q 或 Gln
146.131
H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -
酰胺类
谷氨酸
Glutamic acid
E 或 Glu
147.116
HOOC-(CH 2 ) 2 -
酸性氨基酸类
甘氨酸
Glycine
G 或 Gly
75.052
H-
脂肪族类
组氨酸
Histidine
H 或 His
155.141
N=CH-NH-CH=C-CH 2 -|__________|
碱性氨基酸类
异亮氨酸
Isoleucine
I 或 Ile
131.160
CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )-
脂肪族类
亮氨酸
Leucine
L 或 Leu
131.160
(CH 3 ) 2 -CH-CH 2 -
脂肪族类
赖氨酸
Lysine
K 或 Lys
146.17
H 2 N-(CH 2 ) 4 -
碱性氨基酸类
蛋氨酸
Methionine
M 或 Met
149.199
CH 3 -S-(CH 2 ) 2 -
含硫类
苯丙氨酸
Phenylalanine
F 或 Phe
165.177
Phenyl-CH 2 -
芳香族类
脯氨酸
Proline
P 或 Pro
115.117
-N-(CH 2 ) 3 -CH-|_________|
亚氨基酸
丝氨酸
Serine
S 或 Ser
105.078
HO-CH 2 -
羟基类
苏氨酸
Threonine
T 或 Thr
119.105
CH 3 -CH(OH)-
羟基类
色氨酸
Tryptophan
W 或 Trp
204.213
Phenyl-NH-CH=C-CH 2 -|___________|
芳香族类
酪氨酸
Tyrosine
Y 或 Tyr
181.176
4-OH-Phenyl-CH 2 -
芳香族类
缬氨酸
Valine
V 或 Val
117.133
CH 3 -CH(CH 2 )-
脂肪族类
与核苷酸序列相关的特征关键词表
关键词
说明
allele
相关的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式,该形式区别于这一位置的现有的序列(和或许其它序列)
attenuator
存在调节转录的终止的DNA区域,它控制了一些细菌操纵子的表达; (2)位于启动子和第一个结构基因之间,引起转录的部分终止的序列区段
C_region
免疫球蛋白轻和重链的恒定区,和T-细胞受体α,β,和γ链;根据特定的链可包括一个或多个外显子
CAAT_signal
CAAT盒;位于可能参与RNA聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的75bp上游的保守序列的一部分;共有序列=GG(C或T)CAATCT
CDS
编码序列;对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括终止密码子);特征包括氨基酸概念上的翻译
Conflict
在这一位点或区域,单独确定的“相同”序列有所不同
D-loop
置换环;线粒体DNA内的一个区域,其中RNA的短的序列与DNA的一条链配对,代替了这一区域的原始配对DNA链;也用于说明在RecA蛋白质催化的反应中,侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域
D-segment
免疫球蛋白重链的多变区,和T-细胞受体的β链
Enhancer
顺式-作用序列,它增强了(一些)真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启动子相关的任何位置处 (上游或下游)起作用
Exon
编码剪接mRNA部分的基因组区域;可以含有5UTR,所有CDS,和3UTR
GC_signal
GC盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含GC区域,可以以多重拷贝或任一方向存在;共有序列=GGGCGG
gene
鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称
iDNA
间插DNA;通过几种重组中的任何一种能被消除的DNA
intron
被转录的DNA区段,但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内部将其除去
J_segment
免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和T-细胞受体α,β和γ链
LTR
长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列, 类型典型地见于逆转录病毒中
mat_peptide
成熟的肽或蛋白质的编码序列
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