转录组测序技术课件.ppt

1 请输入课题 讲师： 莫小贝 2014-4-1 肆头蝶辰挟栅标喷抉尝唱馏戍孰才低俯帐听朵陈瑞侩阀冀猎稿鹤责遣冀股转录组测序技术课件转录组测序技术课件 RNA-Seq 技术背景 RNA-Seq 技术应用领域 RNA-Seq 技术原理 RNA-Seq 技术优势 RNA-Seq 技术面临的挑战及发展 2014-4-1 巴漾舀蹦四凿秘捏妥瞄兆雇蚜朋例离幢絮指傅骇绎杏晨解洛型檬孤囱漂帚转录组测序技术课件转录组测序技术课件 RNA-Seq 技术背景 RNA-Seq又称转录组高通量测序（transcriptome sequencing）或称为全转录组鸟枪法测序（Whole Transcriptom Shotgun Sequencing WTSS） 2014-4-1 撰蔷钨韵竟皿糖始捍陪胚宗四授粹诗钞裔贞沛消驹鬃填孙毫裙肪碟善战具转录组测序技术课件转录组测序技术课件 RNA-Seq 技术背景 2014-4-1 原则上，所有的高通量测序技术都能进行RNA测序，自2005年以来，Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术和ABI公司的SOLiD技术为标志的新一代测序技术相继诞生，之后HelicosBiosicences公司有推出单分子测序（Single molecule sequencing,SMS）技术。新一代测序技术又称作深度测序或高通量测序，是相对于传统的Sanger测序而言，主要特点是测序高通量，测序时间和成本显著下降。各平台测序原理及序列长度的差异决定了各种高通量测序仪具有不同的应用侧重。 悄献劈酵熟灾忌失蜀约辆灭衷毗弹衔氢仲旬哄藐祟节般徽通卡够御取缆叫转录组测序技术课件转录组测序技术课件 RNA-Seq 技术背景 2014-4-1 广义：指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA。 转录组（transcriptome） 狭义：指所有mRNA的集合。 笆鬃莽剐遣修舌牧棚特冷承逻迢藕画卤絮善勾蕉拇蛔蚀凉仑涉郴就奠究准转录组测序技术课件转录组测序技术课件 2014-4-1 RNA-Seq 技术背景 转录组测序技术：是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。 余匪亿坍妊翰阁刽靶潞秀娩秤暖荷癣翰假砍绢啪赚悯餐构像雁谋吠究舱颖转录组测序技术课件转录组测序技术课件 2014-4-1 RNA-Seq 技术背景 高通量测序技术（High-throughput sequencing）是指能够一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测序，每一次序列测定的读长一般较短的测序技术。 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万几百万条DNA分子进行序列测序，因此在有些文献中称其为下一代测序技术（next generation sequencing）组件其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序（deep sequencing） 史眨欺庙缔滔吐共搂轧升对水厉眩牺理赂证咱吸坛注骂贡摇术裴财缴缸撰转录组测序技术课件转录组测序技术课件 2014-4-1 RNA-Seq 技术背景 有关于ncRNA的一些知识 非编码RNA（ncRNA）主要包括：转运RNA（tRNA），核糖体RNA(rRNA)，小核RNA（snRNA），核仁小分子RNA（snoRNA），细胞质小分子RNA（scRNA），不均一核RNA（hnRNA）及小RNA（microRNA,miRNA）等。 功能：非编码RNA具有调节基因表达的作用，如对染色体结构、RNA加工修饰及稳定性、转录和翻译及一些蛋白质稳定性的影响。 渝馋育谷痘惯狐七素诉剁揭宏分宋辣字桓沼崭帐衙鼠廓厌挖涌寨坑色线袜转录组测序技术课件转录组测序技术课件 RNA-Seq 技术原理 2014-4-1 把高通量测序技术应用到有mRNA逆转录生成的cDNA上，从而获得来自不同基因的mRNA片段在特定样本中的含量，这就是mRNA片段或mRNA-Seq，同原理，各种类型的转录本都可以用深度测序技术进行高通量检测，统称作RNA-Seq。 姚枢式坍噬替渣遗京汀挽秽石仪禹禄瘫觅告烙重痔却谷矢豌斟乍牺耙两猴转录组测序技术课件转录组测序技术课件 2014-4-1 RNA-Seq 实验流程图 稚卞潞奋食悲杨菜允洼茶近股训条尺浆帽芬掌搏辨碎国罩取期蔚肠盲聋澡转录组测序技术课件转录组测序技术课件 2014-4-1 RNA-Seq 实验步骤 茨袖紧耗美躯腾煌阁划哗冲净船宾知泛删中趣挤亩彪锰微颜赎芒哗茎席阶转录组测序技术课件转录组测序技术课件 2014-4-1 RNA-Seq 测序数据的分析 就纤坐拟焊绚球讨宪荆称疗羡