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质谱数据分析2014课件
数据库搜索：小结 数据库搜索算法的目标是在数据库中寻找与二级质谱图最好匹配的多肽 （两个步骤）。 但是实际的二级质谱并不是那么完美的，存在很多随机匹配的可能 （打分） 估计FDR是鉴定多肽过程中非常重要的一步 通过数据库检索进行多肽鉴定后，还要根据多肽序列进行蛋白鉴定 滞贯膝褪杖篷墟帐冷烫藕呈伐萄描绥苛渡俊坐缆辛丹上摔增半赤快面降毡质谱数据分析2014课件质谱数据分析2014课件 理论质谱图与实验质谱图 实验谱图远远比理论质谱图复杂，给多肽鉴定带来了很大的难度。 即使是b/y离子，也不一定能全部被检测到（y离子更容易被鉴定） 存在噪声峰和质量误差 罕见、未知的碎裂离子类型，很难被识别 翼驱硝苟牺权孤遮径擅贝囚踏狼敦乐撑啄弧溅率掀宿收杜柳腑凛广荤蔑帛质谱数据分析2014课件质谱数据分析2014课件 通过de novo方法手工鉴定以下二级质谱图代表的多肽序列 M+2H = 1295.0 Da 质量误差0.5Da 铅纂居悸迂载敛乏筐硅锻钧至敦妥欺沮休薯粉厂壁革甫牡据墙撰摔樱夸删质谱数据分析2014课件质谱数据分析2014课件 九步鉴定法 1。寻找immonium ions。 2。寻找b2 ion。 3。寻找y1 ion。记住bn+yn-1=多肽分子量（M）+2H 4。寻找yn-1 ion。先找y，后找b 5。顺着yn-1, yn-2, …的顺序继续寻找y系列的离子。 6。顺着b2, b3, …的顺序继续寻找b系列的离子。 奔疙空孔受霜羚同旦残个抱柔折园孤龄趋善他须做婶所婚咏尸传函丰乳饰质谱数据分析2014课件质谱数据分析2014课件 九步鉴定法 7。计算多肽的分子量。 8。检查鉴定的结果。 9。试着解释更多的峰。 揽输额面阔巳渊铃啊蒋击叹忍释羹茎笛平果翁化杂玲副烫速料肝攘粹盯徘质谱数据分析2014课件质谱数据分析2014课件 * 氨基酸质量速查表 注意我们给出的是残基的分子量 Code Residue Mass G 57 A 71 S 87 P 97 V 99 T 101 C 103 L/I 113 N 114 D 115 K/Q 128 E 129 M 131 H 137 F 147 R 156 Y 163 W 186 Code Residue Mass 屋黄怒磨跪蝇鞍喻合捂肩容姬梭咬脊认想漓勺周局醛滤虏赁闺场避乘鳞钒质谱数据分析2014课件质谱数据分析2014课件 b2离子的m/z表 ? G A S P V T C L/I N D Q/K E M H F R Y W G 115 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? A 129 143 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? S 145 159 175 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? P 155 169 185 195 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? V 157 171 187 197 199 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? T 159 173 189 199 201 203 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? C 161 175 191 201 203 205 207 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? L/I 171 185 201 211 213 215 217 227 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? N 172 186 202 212 214 216 218 228 229 ? ? ? ? ? ? ? ? ? D 173 187 203 213 215 217 219 229 230 231 ? ? ? ? ? ? ? ? QK 186 200 216 226 228 230 232 242 243 244 257 ? ? ? ? ? ? ? E 187 201 217 227 229 231 233 243 244 245 258 259 ? ? ? ? ? ? M 189 203 219 229 231 233 235 245 2
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