显微细胞视频的跟踪论文.doc

显微细胞视频的跟踪毕业论文 目 录 摘 要 i 第一章 绪论 3 1.1 研究的背景和意义 3 1.2 国内外研究现状 4 1.3 论文的贡献 5 1.4 本文的组织结构 5 第二章 单帧图像中细胞检测与定位 7 2.1 目标检测 7 2.1.1目标检测算法综述 7 2.1.2基于区域的主动轮廓模型以及通量张量运动物体分割 12 2.2 分割结果二值化 14 2.2.1 图像二值化概述 14 2.2.2 连通性检测 15 2.3 区域填充 16 2.4 噪声的消除 17 2.5 区域参数的提取 17 2.6 细胞与碎片的初步辨别 19 2.7 部分粘连细胞的分离 20 2.8 标记质心 24 2.9 本章小结 24 第三章 基于多假设算法的分割纠正 26 3.1 多假设追踪 26 3.2 基于多假设追踪的分割纠正 28 3.3 多假设追踪算法的判定依据的构建 28 3.4 基于多假设追踪的分割纠正的算法实现 29 3.4.1基于重叠法形成数据聚簇——拓扑结构 29 3.4.2基于拓扑结构和阈值的欠分割、过分割假设的判定 30 3.4.3假设组合与剪枝 33 3.4.4分割纠正 35 3.5 实验结果及分析 36 3.6 本章小结 39 第四章　基于多假设算法的视频图像中的细胞跟踪 41 4.1 细胞跟踪方法综述 41 4.2 基于多假设追踪的细胞跟踪 43 4.2.1基于重叠法形成数据聚簇——拓扑结构 44 4.2.2基于拓扑结构和阈值“移动”或“细胞分裂”这两种假设的判定 44 4.2.3遗留的细胞形成数据聚簇——拓扑结构 46 4.2.4基于拓扑结构和阈值的“快速移动”，“在边界处消失”或“消失”这三种假设的判定 46 4.2 基于多假设追踪的实验结果 47 4.3 本章小结 50 第五章 总结和展望 51 5.1 总结 51 5.2 展望 51 参考文献 53 致谢 56 攻读学位期间参加的科研项目和成果 57  第章 绪 论[1-3]从20世纪 60 年代初开始随着计算机技术的发展而出现、不断地发展和成熟起来的一个新兴的技术领域，数字图像处理技术在理论上和实际运用中都是取得了巨大的成就。数字图像处理的主要研究的方向在于通过对原始图像进行再加工，使之能够拥有更加好的视觉效果或能够满足特定的使用需要，在相应的处理上主要包括图像的采集、编码、存储和传送，以及合成图像，图像的增强、变换或复原等诸多相关的内容。 计算机视觉[4-5]与计算机科学与工程、信号处理、应用数学和统计学、物理学、认知科学和神经生理学等一系列学科都有着极为密切的联系。80 年代初期以来，计算机视觉技术及其相关领域的研究已经经历了一个从走出实验室走向实际应用，从简单的二值图像处理发展到高分辨率多色彩的图像处理，从一般性的对于二维信息处理到针对三维视觉机理的处理的发展阶段，计算机视觉所研究的各种模型和算法都得到了极大的发展。 随着自动化、智能化程度越来越高的今天，作为机器视觉的基础的数字图像处理是机器智能视觉系统的必要工具，计算机视觉的应用领域已经迅速被开阔到交通监控、导航制导、天文观测、医学研究、工业检测、军事侦查、机器人等众多的广泛领域。 在药效研究及新药开发的过程中，如果是做活体测试，则很可能要用培养的活细胞来测定药效以及药物之间的相互作用关系；当研究某些病毒在细胞中的扩散方式的时候，则经常是在电子显微镜下观察病毒入侵正常活细胞这整个过程。以上研究都需要观察细胞的生命活动情况，而其中细胞参数变化量化分析在疾病类型和程度的判断及以上研究之中有非常重要的作用，细胞参数变化量化分析是辅助医学研究逐步由定性描述走向定量研究的重要手段，而要得到细胞的形态变化和运动行为这种定量的研究当中，首先需要对被研究细胞进行相应地识别和跟踪才能进行后续的细胞参数变化[6-7]，如宽度、长度、活跃程度、速度等的计量分析。 在以前的医学及生物学相关领域的研究中我们往往采用以人工为主的方式来观察被研究活细胞的活动[8]，对长达十几个甚至几十个小时的显微细胞活动的即时或视频的观察中，人眼极有可能疲劳，所以仅仅凭借肉眼和经验对显微活细胞的运动进行研究判断很难保证其正确性而且极为浪费宝贵的科研人力。同时，在进行活细胞观察前为了便于观察常常需要给活细胞进行染色，注入这些染料类的化学物质会一定程度上影响活细胞的生理活动，从而影响了实验结果的正确性，最终会影响我国制药及生物学研究水平的提高。 关于视频中目标运动的跟踪，目前其研究热点主要是集中在照相机商业运用比较成熟的领域，例如安防[9-10]、交通[11-12]等，但是在微观领域的研究还是相对比要少。例如细胞运动的研究一直是细胞学和生物学研究的重要组成部分，但是传统的研究方法在技术