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Western Blot操作解析课件
生物化学与分子生物学实验 细胞与分子生物学实验教学平台 Western blot (immunoblotting) 步骤: 优点: 高分辨率的电泳技术 特异敏感的抗原-抗体反应 1-5 ng中等大小的靶蛋白 蛋白提取 Total protein – standard lysis buffer(lipa) Nuclear cytoplasmic extraction (NER-PER, extraction kit, Pierce) To prevent degradation always centrifuge samples at 4℃and include a protease inhibitor ? Protein Qantification : Standard BCA assay (Pierce) Bradford reagent SDS不连续电泳 Poly Acrylamide Gel Electrophoresis(PAGE)is the best method in protein separate。 Use PAGE to separate proteins by MW。 SDS: 阴离子去污剂 变性剂 氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS胶束。 蛋白质-SDS胶束所带的负电荷大大超过了蛋白质分子原有的电荷量,消除了不 同分子之间原有的电荷差异。 与强还原剂一起使蛋白分子氢键、疏水键打开,使蛋白质分子线性化。 蛋白质-SDS胶束的特点: PAGE:聚丙烯酰胺凝胶 聚丙烯酰胺凝胶的聚合方式: 影响聚丙烯酰胺凝胶聚合的因素 试剂的纯度 温度 氧气 〔AP〕〔TEMED〕原则:尽量少的催化剂并在最佳时间内聚合。 凝胶浓度的选择 不同分子量范围的蛋白质应选用不同的凝胶浓度。 不连续电泳: 浓缩效应: 配制: 灌制分离胶 隔绝空气 电泳后染色 蛋白质的电转移(electrotransfer blot) 半干式转膜 注意: 转移单元无气泡 注意方向 戴手套,防止引入污染蛋白 胶、膜大小一致,半干转注意短路。 膜、滤纸要先平衡 20%甲醇改善电转移效果。 转移效果: Ponceau-S Red 固相支持物的选择: 硝酸纤维素膜(nitrocellulose, NC) NC与蛋白质靠疏水作用结合,无需预先活化,对蛋白质的活性影响小; 非特异性本底显色浅; 价格低廉,使用方便。 结合在NC上的小分子蛋白质在洗涤时易丢失; NC韧性较差,易损坏。 Polyvinylidene fluoride (PVDF) 与蛋白质亲和力高,用前需在甲醇中浸泡,以活化膜上的正电基团,使其更容易与带负电荷蛋白结合。 封闭: -5% BSA或non-fat-dry-milk (RT or 4℃) -incubation time : 60 min - O/N Tween-20的作用:减少非特异性吸附不影响 抗体与抗原的结合 靶蛋白的免疫学检测 Poor Transfer Adjust composition of the transfer buffer Methanol SDS Transfer of a range of proteins with different molecular weights Transfer of a broad MW range of proteins may require a multi-step transfer. Start at low current/voltage to give good binding of low molecular weight proteins After 30 minutes increase current/voltage to promote elution of high molecular weight proteins Citation: Two Step Electrotransfer Procedure - T. Otter et al, Anal. Biochem. 162: 370-377 (1987) Primary antibody dilution: higher specificity Secondary antibody dilution: lower backgr
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