题目：局部比对算法及其在生物信息学中的应用.PPT

* * * * * * * * * * * * * * * * COMPANY LOGO Company Logo Company LOGO 文献综述题目 第一章 分子生物学和生物化学 1、大量教科书中对分子生物学都有很好很全面的描述，要了解和认识基因，见： P.Portin,1993,The concept of the gene: Short history and present status,Q.Rev.Biol.68:173-223. 人们是如何了解和认识基因的？ 题目：人们了解和认识基因的过程； 第一章 分子生物学和生物化学 2、Watson和Crick因发现DNA的结构而获得诺贝尔奖。 他们的经典单页论文见： J.D.Waston and F.H.C.Crick,1953,Genetical implications of the structure of deoxyribonucleic acid,Nature 171:964-967. Waston和Crick是如何发现DNA结构的？DNA结构是什么样的？ 题目： DNA结构； 第二章 数据库搜索与两两比对 3、PAM矩阵是由M.Dayhoff、R.M.Schwatz与B.C.Orcutt首先提出的，见： M.Dayhoff,R.M.Schwartz and B.C.Orcutt,1978,A model of evolutionary change in proteins, in Atlas of Protein Sequence and Structure, Vol.5, pp:345-352, National Biomedical Research Foundation, Silver Spring, MD. 什么是PAM矩阵？PAM矩阵有什么应用？ 题目： PAM矩阵及其在生物信息学中的应用； 第二章 数据库搜索与两两比对 4、使用BLOSUM矩阵是为比对打分的另一种方法，见： S.Henikoff and J.G.Henikoff,1992, Amino acid substitution matrices from protein blocks, Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 89: 10915-10919. 什么是BLOSUM矩阵？BLOSUM矩阵有什么应用？ 题目： BLOSUM 矩阵及其在生物信息学中的应用； 第二章 数据库搜索与两两比对 5、Needleman与Wunsch提出了进行全局序列比对的具体算法，见： S.B.Needleman and C.D.Wunsch, 1970, A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequences of two proteins, J. Mol. Biol. 48: 443-453. 什么是全局比对算法？全局比对算法有什么应用？ 题目：全局比对算法及其在生物信息学中的应用； 第二章 数据库搜索与两两比对 6、Smith与Waterman提出了局部比对算法，见： F.F.Smith and M.S.Waterman, 1981, Identification of common molecular subsequences, J. Mol. Biol. 147: 195-197. 什么是局部比对算法？局部比对算法有什么应用？ 题目：局部比对算法及其在生物信息学中的应用； 第二章 数据库搜索与两两比对 7、著名的BLAST引擎是用来进行序列数据库搜索的，见： S.F.Altschul, W.Gish, W.Miller, E.W.Myers, and D.J.Lipman, 1990, A basic local alignment search tool, J.Mol.Biol. 215: 403-410. 什么是BLAST引擎？BLAST引擎有什么应用？ 题目： BLAST引擎及其在生物信息学中的应用； 第二章 数据库搜索与两两比对 8、FAST是另一种进行序列搜索与比对的方法，见： D. J. Lipman and W. R. Pearson, 1985, Rapid and sensitive protein similarity search, Science 227: 143