古DNA及其考古学意义.PDF

第十届中国古脊椎动物学学术年会论文集. 董为主编. 北京：海洋出版社, 2006. 143~153 Proceedings of the Tenth Annual Meeting of the Chinese Society of Vertebrate Paleontology DONG Wei (ed). Beijing: China Ocean Press, 2006. 143~153 古DNA 及其考古学意义∗ 徐 智 谭婧泽 李士林 钱 吉 金建中 金 力 (复旦大学现代人类学教育部重点实验室、生命科学学院遗传学研究所，上海200433) 摘 要 古DNA 是指从考古和化石材料中得到的DNA 。在过去的20 年里，随着科学技术的 发展，古 DNA 研究经历了从个别样品中获取线粒体 DNA 小片段，到大范围研究古代群体， 甚至灭绝生物的线粒体或核基因组全序列。但是，很多问题也逐渐显现出来，诸如低估污染而 导致的错误结果。为此，科学家们开始提出古DNA 研究的严格标准。可以肯定，古 DNA 已 经成为生物学研究的一个强有力的工具，帮助人们从一个全新的角度来解读生物的进化过程。 关键词 古DNA 污染 线粒体 考古学 DNA技术的发展，使科学家们可以通过现代DNA序列比较，研究生物的进化。但 是现代DNA只能提供现代的、空间上的、间接的遗传信息，时间上的、直接的遗传信 息，尤其是灭绝生物的遗传信息获取非常重要。古DNA 由于其材料来源的特殊性和所 反映的遗传信息的时空差异性，能够提供有关现代生物和过去生物之间谱系关系的独 特的、定量的信息[1]，至少在一个很小的地质学年代范围内，提供了一个崭新的手段。 但是，由于存在很多技术缺陷，古DNA研究需要严格的标准以确保结果的可靠性。 本文简单回顾了古DNA研究的历史，介绍了古DNA 的损伤、技术手段、污染、可 靠性标准以及应用。 1 古DNA 的研究历史 最早的古DNA研究是用克隆的方法从动物皮肤和木乃伊标本上得到很短的DNA 序列[2~3] ，这些研究开创了古DNA研究的先河，同时也揭示了在古代样品中存在的遗 传物质，主要是细菌或真菌的，而内源的DNA仅以降解的、含量很少的短片段存在。 1983年，聚合酶链式反应，即PCR 的发明[4]，使研究人员可以用少量甚至单分子DNA 模板通过体外扩增的方式获得大量的DNA拷贝，这一突破性技术使得古DNA研究飞速 发展[5~8] 。 在随后的几年中，古DNA 的报道铺天盖地，包括中新世（距今20 Ma～17 Ma）木 兰属（Magnolia ）植物化石中获取叶绿体DNA 的rbcL序列[9]、白垩纪（距今约135 Ma～ 120 Ma）恐龙骨骼中提取的DNA[10] 以及从琥珀中提取的DNA[11~16] 。 1994年以后，许多科学家开始考虑古DNA 的真实性问题，并且发现很多报道的古 国家自然科学基金）资助 徐智：男，27 岁，在读博士生，主要从事分子人类学研究 143 DNA其实是来源于实验室的人或者细菌的污染[17~18]，而且没有经过独立重复的实验验 证[19~20] [21] 。以至于有些科学家认为所有得到的古DNA都是一些PCR污染产物 。 1997年，Krings等人从德国出土的约5万年前的尼安德特人（Neanderthal ）化石中 成功地提取了线粒体DNA片段作为模板进行PCR扩增和测序，在同全世界1 600例现代 人的线粒体DNA进行比较之后，证明了尼安德特人与现代欧洲人没有直接的继承关 系，说明它只是现代人的旁系远亲而非直系祖先，支持了现代人起源于非洲的学说[22] 。 对尼安德特人研究的成功[22~24]，不仅证实了古DNA 的存在以及研究的科学性，而且提 示古DNA对于研究早期人类的进化和迁徙具有重大意义。 为保证可靠性，许多科学家开始呼吁建立严格的古DNA研究标准[25]。经